Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE2

Tmem223, Transmembrane protein 223, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem223Q9CQE2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem223Q9CQE2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem223Q9CQE2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem223Q9CQE2 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem223Q9CQE2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem223Q9CQE2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem223Q9CQE2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem223Q9CQE2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem223Q9CQE2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem223Q9CQE2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem223Q9CQE2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem223Q9CQE2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem223Q9CQE2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem223Q9CQE2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem223Q9CQE2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem223Q9CQE2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem223Q9CQE2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem223Q9CQE2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem223Q9CQE2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem223Q9CQE2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem223Q9CQE2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem223Q9CQE2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem223Q9CQE2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem223Q9CQE2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem223Q9CQE2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem223Q9CQE2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem223Q9CQE2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem223Q9CQE2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem223Q9CQE2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem223Q9CQE2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem223Q9CQE2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem223Q9CQE2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem223Q9CQE2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem223Q9CQE2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem223Q9CQE2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem223Q9CQE2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem223Q9CQE2 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem223Q9CQE2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem223Q9CQE2 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem223Q9CQE2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem223Q9CQE2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem223Q9CQE2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem223Q9CQE2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem223Q9CQE2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem223Q9CQE2 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem223Q9CQE2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem223Q9CQE2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem223Q9CQE2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem223Q9CQE2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem223Q9CQE2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem223Q9CQE2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem223Q9CQE2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem223Q9CQE2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem223Q9CQE2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem223Q9CQE2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem223Q9CQE2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem223Q9CQE2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem223Q9CQE2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem223Q9CQE2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem223Q9CQE2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem223Q9CQE2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem223Q9CQE2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem223Q9CQE2 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem223Q9CQE2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem223Q9CQE2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem223Q9CQE2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem223Q9CQE2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem223Q9CQE2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem223Q9CQE2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem223Q9CQE2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem223Q9CQE2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem223Q9CQE2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem223Q9CQE2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem223Q9CQE2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem223Q9CQE2 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem223Q9CQE2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem223Q9CQE2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem223Q9CQE2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem223Q9CQE2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem223Q9CQE2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem223Q9CQE2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem223Q9CQE2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem223Q9CQE2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem223Q9CQE2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem223Q9CQE2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem223Q9CQE2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem223Q9CQE2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem223Q9CQE2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem223Q9CQE2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmem223Q9CQE2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem223Q9CQE2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem223Q9CQE2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem223Q9CQE2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem223Q9CQE2 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem223Q9CQE2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem223Q9CQE2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem223Q9CQE2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem223Q9CQE2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem223Q9CQE2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem223Q9CQE2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms