Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA5

Med4, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med4Q9CQA5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Med4Q9CQA5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Med4Q9CQA5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Med4Q9CQA5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Med4Q9CQA5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Med4Q9CQA5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Med4Q9CQA5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Med4Q9CQA5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Med4Q9CQA5 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Med4Q9CQA5 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Med4Q9CQA5 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Med4Q9CQA5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Med4Q9CQA5 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Med4Q9CQA5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Med4Q9CQA5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Med4Q9CQA5 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Med4Q9CQA5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Med4Q9CQA5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Med4Q9CQA5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Med4Q9CQA5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Med4Q9CQA5 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Med4Q9CQA5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Med4Q9CQA5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Med4Q9CQA5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Med4Q9CQA5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Med4Q9CQA5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Med4Q9CQA5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Med4Q9CQA5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Med4Q9CQA5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Med4Q9CQA5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Med4Q9CQA5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Med4Q9CQA5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Med4Q9CQA5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Med4Q9CQA5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Med4Q9CQA5 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Med4Q9CQA5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Med4Q9CQA5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Med4Q9CQA5 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Med4Q9CQA5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Med4Q9CQA5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Med4Q9CQA5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Med4Q9CQA5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Med4Q9CQA5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Med4Q9CQA5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Med4Q9CQA5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Med4Q9CQA5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Med4Q9CQA5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Med4Q9CQA5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Med4Q9CQA5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Med4Q9CQA5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Med4Q9CQA5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Med4Q9CQA5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Med4Q9CQA5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Med4Q9CQA5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Med4Q9CQA5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Med4Q9CQA5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Med4Q9CQA5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Med4Q9CQA5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Med4Q9CQA5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Med4Q9CQA5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Med4Q9CQA5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Med4Q9CQA5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Med4Q9CQA5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Med4Q9CQA5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Med4Q9CQA5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Med4Q9CQA5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Med4Q9CQA5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Med4Q9CQA5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Med4Q9CQA5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Med4Q9CQA5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Med4Q9CQA5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Med4Q9CQA5 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Med4Q9CQA5 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Med4Q9CQA5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Med4Q9CQA5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Med4Q9CQA5 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Med4Q9CQA5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Med4Q9CQA5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Med4Q9CQA5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Med4Q9CQA5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Med4Q9CQA5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Med4Q9CQA5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Med4Q9CQA5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Med4Q9CQA5 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Med4Q9CQA5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Med4Q9CQA5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Med4Q9CQA5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Med4Q9CQA5 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Med4Q9CQA5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Med4Q9CQA5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Med4Q9CQA5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Med4Q9CQA5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Med4Q9CQA5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Med4Q9CQA5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Med4Q9CQA5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Med4Q9CQA5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Med4Q9CQA5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Med4Q9CQA5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Med4Q9CQA5 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Med4Q9CQA5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms