Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ76

Nepn, Nephrocan, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NepnQ9CQ76 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NepnQ9CQ76 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NepnQ9CQ76 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NepnQ9CQ76 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NepnQ9CQ76 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NepnQ9CQ76 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NepnQ9CQ76 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NepnQ9CQ76 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NepnQ9CQ76 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NepnQ9CQ76 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NepnQ9CQ76 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NepnQ9CQ76 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NepnQ9CQ76 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NepnQ9CQ76 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NepnQ9CQ76 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NepnQ9CQ76 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NepnQ9CQ76 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
NepnQ9CQ76 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NepnQ9CQ76 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NepnQ9CQ76 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
NepnQ9CQ76 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NepnQ9CQ76 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NepnQ9CQ76 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NepnQ9CQ76 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NepnQ9CQ76 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NepnQ9CQ76 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NepnQ9CQ76 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
NepnQ9CQ76 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NepnQ9CQ76 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NepnQ9CQ76 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NepnQ9CQ76 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
NepnQ9CQ76 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NepnQ9CQ76 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NepnQ9CQ76 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NepnQ9CQ76 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NepnQ9CQ76 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NepnQ9CQ76 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NepnQ9CQ76 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NepnQ9CQ76 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NepnQ9CQ76 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NepnQ9CQ76 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NepnQ9CQ76 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
NepnQ9CQ76 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NepnQ9CQ76 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NepnQ9CQ76 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NepnQ9CQ76 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NepnQ9CQ76 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NepnQ9CQ76 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NepnQ9CQ76 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
NepnQ9CQ76 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NepnQ9CQ76 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NepnQ9CQ76 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NepnQ9CQ76 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NepnQ9CQ76 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NepnQ9CQ76 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NepnQ9CQ76 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NepnQ9CQ76 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NepnQ9CQ76 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NepnQ9CQ76 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NepnQ9CQ76 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NepnQ9CQ76 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NepnQ9CQ76 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NepnQ9CQ76 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NepnQ9CQ76 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
NepnQ9CQ76 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NepnQ9CQ76 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NepnQ9CQ76 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NepnQ9CQ76 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NepnQ9CQ76 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NepnQ9CQ76 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NepnQ9CQ76 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NepnQ9CQ76 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NepnQ9CQ76 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NepnQ9CQ76 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NepnQ9CQ76 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NepnQ9CQ76 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NepnQ9CQ76 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NepnQ9CQ76 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NepnQ9CQ76 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NepnQ9CQ76 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NepnQ9CQ76 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NepnQ9CQ76 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NepnQ9CQ76 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NepnQ9CQ76 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NepnQ9CQ76 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NepnQ9CQ76 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NepnQ9CQ76 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NepnQ9CQ76 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NepnQ9CQ76 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NepnQ9CQ76 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NepnQ9CQ76 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NepnQ9CQ76 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NepnQ9CQ76 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NepnQ9CQ76 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NepnQ9CQ76 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NepnQ9CQ76 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NepnQ9CQ76 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NepnQ9CQ76 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NepnQ9CQ76 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NepnQ9CQ76 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms