Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rpa3Q9CQ71 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rpa3Q9CQ71 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rpa3Q9CQ71 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Rpa3Q9CQ71 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rpa3Q9CQ71 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Rpa3Q9CQ71 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Rpa3Q9CQ71 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rpa3Q9CQ71 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rpa3Q9CQ71 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rpa3Q9CQ71 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rpa3Q9CQ71 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rpa3Q9CQ71 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rpa3Q9CQ71 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Rpa3Q9CQ71 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rpa3Q9CQ71 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rpa3Q9CQ71 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rpa3Q9CQ71 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rpa3Q9CQ71 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Rpa3Q9CQ71 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Rpa3Q9CQ71 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Rpa3Q9CQ71 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rpa3Q9CQ71 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rpa3Q9CQ71 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rpa3Q9CQ71 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rpa3Q9CQ71 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rpa3Q9CQ71 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rpa3Q9CQ71 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rpa3Q9CQ71 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rpa3Q9CQ71 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rpa3Q9CQ71 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rpa3Q9CQ71 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rpa3Q9CQ71 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rpa3Q9CQ71 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rpa3Q9CQ71 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rpa3Q9CQ71 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rpa3Q9CQ71 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rpa3Q9CQ71 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rpa3Q9CQ71 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rpa3Q9CQ71 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rpa3Q9CQ71 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rpa3Q9CQ71 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Rpa3Q9CQ71 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rpa3Q9CQ71 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Rpa3Q9CQ71 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rpa3Q9CQ71 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rpa3Q9CQ71 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rpa3Q9CQ71 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rpa3Q9CQ71 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rpa3Q9CQ71 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rpa3Q9CQ71 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rpa3Q9CQ71 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rpa3Q9CQ71 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rpa3Q9CQ71 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rpa3Q9CQ71 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rpa3Q9CQ71 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rpa3Q9CQ71 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rpa3Q9CQ71 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rpa3Q9CQ71 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rpa3Q9CQ71 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rpa3Q9CQ71 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rpa3Q9CQ71 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rpa3Q9CQ71 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rpa3Q9CQ71 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rpa3Q9CQ71 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rpa3Q9CQ71 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rpa3Q9CQ71 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rpa3Q9CQ71 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Rpa3Q9CQ71 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rpa3Q9CQ71 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rpa3Q9CQ71 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rpa3Q9CQ71 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rpa3Q9CQ71 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rpa3Q9CQ71 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Rpa3Q9CQ71 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rpa3Q9CQ71 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rpa3Q9CQ71 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rpa3Q9CQ71 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rpa3Q9CQ71 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rpa3Q9CQ71 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rpa3Q9CQ71 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rpa3Q9CQ71 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rpa3Q9CQ71 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rpa3Q9CQ71 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rpa3Q9CQ71 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rpa3Q9CQ71 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rpa3Q9CQ71 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rpa3Q9CQ71 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rpa3Q9CQ71 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rpa3Q9CQ71 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rpa3Q9CQ71 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rpa3Q9CQ71 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rpa3Q9CQ71 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rpa3Q9CQ71 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rpa3Q9CQ71 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rpa3Q9CQ71 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rpa3Q9CQ71 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rpa3Q9CQ71 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rpa3Q9CQ71 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rpa3Q9CQ71 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms