Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ18

Rnaseh2c, Ribonuclease H2 subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnaseh2cQ9CQ18 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rnaseh2cQ9CQ18 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rnaseh2cQ9CQ18 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rnaseh2cQ9CQ18 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rnaseh2cQ9CQ18 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rnaseh2cQ9CQ18 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rnaseh2cQ9CQ18 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rnaseh2cQ9CQ18 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rnaseh2cQ9CQ18 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rnaseh2cQ9CQ18 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rnaseh2cQ9CQ18 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rnaseh2cQ9CQ18 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Rnaseh2cQ9CQ18 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rnaseh2cQ9CQ18 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms