Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV0

Prpf8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf8Q99PV0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prpf8Q99PV0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prpf8Q99PV0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prpf8Q99PV0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prpf8Q99PV0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prpf8Q99PV0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prpf8Q99PV0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Prpf8Q99PV0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prpf8Q99PV0 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prpf8Q99PV0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prpf8Q99PV0 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Prpf8Q99PV0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prpf8Q99PV0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prpf8Q99PV0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prpf8Q99PV0 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prpf8Q99PV0 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prpf8Q99PV0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prpf8Q99PV0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prpf8Q99PV0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prpf8Q99PV0 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prpf8Q99PV0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prpf8Q99PV0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Prpf8Q99PV0 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prpf8Q99PV0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prpf8Q99PV0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prpf8Q99PV0 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Prpf8Q99PV0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prpf8Q99PV0 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Prpf8Q99PV0 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prpf8Q99PV0 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Prpf8Q99PV0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prpf8Q99PV0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prpf8Q99PV0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prpf8Q99PV0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prpf8Q99PV0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prpf8Q99PV0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prpf8Q99PV0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prpf8Q99PV0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prpf8Q99PV0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prpf8Q99PV0 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Prpf8Q99PV0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Prpf8Q99PV0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prpf8Q99PV0 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prpf8Q99PV0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prpf8Q99PV0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Prpf8Q99PV0 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prpf8Q99PV0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prpf8Q99PV0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prpf8Q99PV0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prpf8Q99PV0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prpf8Q99PV0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prpf8Q99PV0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prpf8Q99PV0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prpf8Q99PV0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prpf8Q99PV0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Prpf8Q99PV0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prpf8Q99PV0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prpf8Q99PV0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Prpf8Q99PV0 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prpf8Q99PV0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prpf8Q99PV0 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prpf8Q99PV0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prpf8Q99PV0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prpf8Q99PV0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prpf8Q99PV0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prpf8Q99PV0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prpf8Q99PV0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Prpf8Q99PV0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prpf8Q99PV0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Prpf8Q99PV0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prpf8Q99PV0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prpf8Q99PV0 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prpf8Q99PV0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prpf8Q99PV0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prpf8Q99PV0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prpf8Q99PV0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prpf8Q99PV0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prpf8Q99PV0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prpf8Q99PV0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prpf8Q99PV0 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prpf8Q99PV0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prpf8Q99PV0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Prpf8Q99PV0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prpf8Q99PV0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prpf8Q99PV0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prpf8Q99PV0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prpf8Q99PV0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prpf8Q99PV0 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Prpf8Q99PV0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prpf8Q99PV0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prpf8Q99PV0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prpf8Q99PV0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prpf8Q99PV0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prpf8Q99PV0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prpf8Q99PV0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prpf8Q99PV0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prpf8Q99PV0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Prpf8Q99PV0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Prpf8Q99PV0 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Prpf8Q99PV0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms