Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gtf2a1Q99PM3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Gtf2a1Q99PM3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Gtf2a1Q99PM3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Gtf2a1Q99PM3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Gtf2a1Q99PM3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gtf2a1Q99PM3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gtf2a1Q99PM3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gtf2a1Q99PM3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gtf2a1Q99PM3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gtf2a1Q99PM3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gtf2a1Q99PM3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gtf2a1Q99PM3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gtf2a1Q99PM3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Gtf2a1Q99PM3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gtf2a1Q99PM3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gtf2a1Q99PM3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gtf2a1Q99PM3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gtf2a1Q99PM3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gtf2a1Q99PM3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gtf2a1Q99PM3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gtf2a1Q99PM3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gtf2a1Q99PM3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Gtf2a1Q99PM3 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Gtf2a1Q99PM3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gtf2a1Q99PM3 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gtf2a1Q99PM3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gtf2a1Q99PM3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gtf2a1Q99PM3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gtf2a1Q99PM3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gtf2a1Q99PM3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gtf2a1Q99PM3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gtf2a1Q99PM3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gtf2a1Q99PM3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gtf2a1Q99PM3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gtf2a1Q99PM3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gtf2a1Q99PM3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gtf2a1Q99PM3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gtf2a1Q99PM3 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gtf2a1Q99PM3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gtf2a1Q99PM3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gtf2a1Q99PM3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gtf2a1Q99PM3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Gtf2a1Q99PM3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Gtf2a1Q99PM3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gtf2a1Q99PM3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gtf2a1Q99PM3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gtf2a1Q99PM3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gtf2a1Q99PM3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gtf2a1Q99PM3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gtf2a1Q99PM3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Gtf2a1Q99PM3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gtf2a1Q99PM3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gtf2a1Q99PM3 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gtf2a1Q99PM3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gtf2a1Q99PM3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gtf2a1Q99PM3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gtf2a1Q99PM3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gtf2a1Q99PM3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gtf2a1Q99PM3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gtf2a1Q99PM3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gtf2a1Q99PM3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gtf2a1Q99PM3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Gtf2a1Q99PM3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gtf2a1Q99PM3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gtf2a1Q99PM3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gtf2a1Q99PM3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gtf2a1Q99PM3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gtf2a1Q99PM3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gtf2a1Q99PM3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gtf2a1Q99PM3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gtf2a1Q99PM3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gtf2a1Q99PM3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gtf2a1Q99PM3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gtf2a1Q99PM3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gtf2a1Q99PM3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gtf2a1Q99PM3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Gtf2a1Q99PM3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gtf2a1Q99PM3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gtf2a1Q99PM3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gtf2a1Q99PM3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gtf2a1Q99PM3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gtf2a1Q99PM3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gtf2a1Q99PM3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Gtf2a1Q99PM3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Gtf2a1Q99PM3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gtf2a1Q99PM3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gtf2a1Q99PM3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gtf2a1Q99PM3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gtf2a1Q99PM3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gtf2a1Q99PM3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gtf2a1Q99PM3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gtf2a1Q99PM3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Gtf2a1Q99PM3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gtf2a1Q99PM3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gtf2a1Q99PM3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gtf2a1Q99PM3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gtf2a1Q99PM3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gtf2a1Q99PM3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gtf2a1Q99PM3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 192.5 ms