Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL7

Scd3, Acyl-CoA desaturase 3, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scd3Q99PL7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Scd3Q99PL7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Scd3Q99PL7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Scd3Q99PL7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Scd3Q99PL7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Scd3Q99PL7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Scd3Q99PL7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Scd3Q99PL7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Scd3Q99PL7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Scd3Q99PL7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Scd3Q99PL7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Scd3Q99PL7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Scd3Q99PL7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Scd3Q99PL7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Scd3Q99PL7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Scd3Q99PL7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Scd3Q99PL7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Scd3Q99PL7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Scd3Q99PL7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Scd3Q99PL7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Scd3Q99PL7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Scd3Q99PL7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Scd3Q99PL7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Scd3Q99PL7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Scd3Q99PL7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Scd3Q99PL7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Scd3Q99PL7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Scd3Q99PL7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Scd3Q99PL7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Scd3Q99PL7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Scd3Q99PL7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scd3Q99PL7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scd3Q99PL7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scd3Q99PL7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Scd3Q99PL7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scd3Q99PL7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scd3Q99PL7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scd3Q99PL7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scd3Q99PL7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Scd3Q99PL7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Scd3Q99PL7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Scd3Q99PL7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Scd3Q99PL7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Scd3Q99PL7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Scd3Q99PL7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scd3Q99PL7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scd3Q99PL7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scd3Q99PL7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scd3Q99PL7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scd3Q99PL7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scd3Q99PL7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Scd3Q99PL7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scd3Q99PL7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scd3Q99PL7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scd3Q99PL7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scd3Q99PL7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scd3Q99PL7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scd3Q99PL7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Scd3Q99PL7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Scd3Q99PL7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Scd3Q99PL7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scd3Q99PL7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scd3Q99PL7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scd3Q99PL7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scd3Q99PL7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scd3Q99PL7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scd3Q99PL7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scd3Q99PL7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scd3Q99PL7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scd3Q99PL7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scd3Q99PL7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scd3Q99PL7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scd3Q99PL7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scd3Q99PL7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scd3Q99PL7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scd3Q99PL7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scd3Q99PL7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Scd3Q99PL7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Scd3Q99PL7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Scd3Q99PL7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scd3Q99PL7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scd3Q99PL7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scd3Q99PL7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scd3Q99PL7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scd3Q99PL7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scd3Q99PL7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scd3Q99PL7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scd3Q99PL7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scd3Q99PL7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scd3Q99PL7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scd3Q99PL7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scd3Q99PL7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scd3Q99PL7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scd3Q99PL7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scd3Q99PL7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scd3Q99PL7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scd3Q99PL7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scd3Q99PL7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scd3Q99PL7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scd3Q99PL7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms