Protein–RNA interactions for Protein: Q99P91

Gpnmb, Transmembrane glycoprotein NMB, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GpnmbQ99P91 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GpnmbQ99P91 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GpnmbQ99P91 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GpnmbQ99P91 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GpnmbQ99P91 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GpnmbQ99P91 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GpnmbQ99P91 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GpnmbQ99P91 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GpnmbQ99P91 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GpnmbQ99P91 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GpnmbQ99P91 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GpnmbQ99P91 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GpnmbQ99P91 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GpnmbQ99P91 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GpnmbQ99P91 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GpnmbQ99P91 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GpnmbQ99P91 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GpnmbQ99P91 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GpnmbQ99P91 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GpnmbQ99P91 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GpnmbQ99P91 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GpnmbQ99P91 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GpnmbQ99P91 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GpnmbQ99P91 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GpnmbQ99P91 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GpnmbQ99P91 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GpnmbQ99P91 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GpnmbQ99P91 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GpnmbQ99P91 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GpnmbQ99P91 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GpnmbQ99P91 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GpnmbQ99P91 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GpnmbQ99P91 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GpnmbQ99P91 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GpnmbQ99P91 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GpnmbQ99P91 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
GpnmbQ99P91 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GpnmbQ99P91 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GpnmbQ99P91 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GpnmbQ99P91 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GpnmbQ99P91 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GpnmbQ99P91 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GpnmbQ99P91 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GpnmbQ99P91 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GpnmbQ99P91 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GpnmbQ99P91 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GpnmbQ99P91 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GpnmbQ99P91 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GpnmbQ99P91 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GpnmbQ99P91 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GpnmbQ99P91 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GpnmbQ99P91 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GpnmbQ99P91 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GpnmbQ99P91 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GpnmbQ99P91 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GpnmbQ99P91 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GpnmbQ99P91 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GpnmbQ99P91 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GpnmbQ99P91 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GpnmbQ99P91 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GpnmbQ99P91 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GpnmbQ99P91 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GpnmbQ99P91 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GpnmbQ99P91 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GpnmbQ99P91 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GpnmbQ99P91 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GpnmbQ99P91 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GpnmbQ99P91 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GpnmbQ99P91 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GpnmbQ99P91 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GpnmbQ99P91 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GpnmbQ99P91 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GpnmbQ99P91 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GpnmbQ99P91 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GpnmbQ99P91 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GpnmbQ99P91 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GpnmbQ99P91 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GpnmbQ99P91 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GpnmbQ99P91 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GpnmbQ99P91 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GpnmbQ99P91 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GpnmbQ99P91 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GpnmbQ99P91 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GpnmbQ99P91 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GpnmbQ99P91 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GpnmbQ99P91 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GpnmbQ99P91 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GpnmbQ99P91 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GpnmbQ99P91 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GpnmbQ99P91 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GpnmbQ99P91 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GpnmbQ99P91 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GpnmbQ99P91 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GpnmbQ99P91 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GpnmbQ99P91 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GpnmbQ99P91 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GpnmbQ99P91 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GpnmbQ99P91 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GpnmbQ99P91 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GpnmbQ99P91 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms