Protein–RNA interactions for Protein: Q99N89

Mrpl43, 39S ribosomal protein L43, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl43Q99N89 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mrpl43Q99N89 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mrpl43Q99N89 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mrpl43Q99N89 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mrpl43Q99N89 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mrpl43Q99N89 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mrpl43Q99N89 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mrpl43Q99N89 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mrpl43Q99N89 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mrpl43Q99N89 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mrpl43Q99N89 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mrpl43Q99N89 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mrpl43Q99N89 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mrpl43Q99N89 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mrpl43Q99N89 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mrpl43Q99N89 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mrpl43Q99N89 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Mrpl43Q99N89 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Mrpl43Q99N89 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mrpl43Q99N89 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mrpl43Q99N89 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mrpl43Q99N89 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mrpl43Q99N89 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mrpl43Q99N89 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mrpl43Q99N89 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mrpl43Q99N89 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mrpl43Q99N89 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mrpl43Q99N89 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mrpl43Q99N89 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mrpl43Q99N89 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mrpl43Q99N89 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mrpl43Q99N89 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Mrpl43Q99N89 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Mrpl43Q99N89 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Mrpl43Q99N89 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Mrpl43Q99N89 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Mrpl43Q99N89 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Mrpl43Q99N89 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Mrpl43Q99N89 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mrpl43Q99N89 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mrpl43Q99N89 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Mrpl43Q99N89 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Mrpl43Q99N89 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Mrpl43Q99N89 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mrpl43Q99N89 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mrpl43Q99N89 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mrpl43Q99N89 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mrpl43Q99N89 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mrpl43Q99N89 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mrpl43Q99N89 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mrpl43Q99N89 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mrpl43Q99N89 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mrpl43Q99N89 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mrpl43Q99N89 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mrpl43Q99N89 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mrpl43Q99N89 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mrpl43Q99N89 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mrpl43Q99N89 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mrpl43Q99N89 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mrpl43Q99N89 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mrpl43Q99N89 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mrpl43Q99N89 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mrpl43Q99N89 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mrpl43Q99N89 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mrpl43Q99N89 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mrpl43Q99N89 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Mrpl43Q99N89 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mrpl43Q99N89 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mrpl43Q99N89 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mrpl43Q99N89 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mrpl43Q99N89 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mrpl43Q99N89 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mrpl43Q99N89 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mrpl43Q99N89 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mrpl43Q99N89 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Mrpl43Q99N89 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Mrpl43Q99N89 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Mrpl43Q99N89 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Mrpl43Q99N89 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Mrpl43Q99N89 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Mrpl43Q99N89 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Mrpl43Q99N89 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Mrpl43Q99N89 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Mrpl43Q99N89 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Mrpl43Q99N89 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Mrpl43Q99N89 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Mrpl43Q99N89 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Mrpl43Q99N89 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Mrpl43Q99N89 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Mrpl43Q99N89 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Mrpl43Q99N89 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Mrpl43Q99N89 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Mrpl43Q99N89 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Mrpl43Q99N89 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Mrpl43Q99N89 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Mrpl43Q99N89 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Mrpl43Q99N89 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Mrpl43Q99N89 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Mrpl43Q99N89 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Mrpl43Q99N89 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.6 ms