Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SrrtQ99MR6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
SrrtQ99MR6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
SrrtQ99MR6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SrrtQ99MR6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SrrtQ99MR6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SrrtQ99MR6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SrrtQ99MR6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SrrtQ99MR6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SrrtQ99MR6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SrrtQ99MR6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SrrtQ99MR6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SrrtQ99MR6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SrrtQ99MR6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SrrtQ99MR6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SrrtQ99MR6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SrrtQ99MR6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SrrtQ99MR6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SrrtQ99MR6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SrrtQ99MR6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SrrtQ99MR6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SrrtQ99MR6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SrrtQ99MR6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SrrtQ99MR6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SrrtQ99MR6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SrrtQ99MR6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SrrtQ99MR6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SrrtQ99MR6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SrrtQ99MR6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SrrtQ99MR6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SrrtQ99MR6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SrrtQ99MR6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SrrtQ99MR6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SrrtQ99MR6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SrrtQ99MR6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SrrtQ99MR6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SrrtQ99MR6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SrrtQ99MR6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SrrtQ99MR6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SrrtQ99MR6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SrrtQ99MR6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SrrtQ99MR6 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SrrtQ99MR6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SrrtQ99MR6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SrrtQ99MR6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SrrtQ99MR6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SrrtQ99MR6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SrrtQ99MR6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SrrtQ99MR6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SrrtQ99MR6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SrrtQ99MR6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SrrtQ99MR6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SrrtQ99MR6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SrrtQ99MR6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SrrtQ99MR6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SrrtQ99MR6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SrrtQ99MR6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SrrtQ99MR6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SrrtQ99MR6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SrrtQ99MR6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SrrtQ99MR6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SrrtQ99MR6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SrrtQ99MR6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SrrtQ99MR6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SrrtQ99MR6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SrrtQ99MR6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SrrtQ99MR6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SrrtQ99MR6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SrrtQ99MR6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SrrtQ99MR6 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SrrtQ99MR6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SrrtQ99MR6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SrrtQ99MR6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SrrtQ99MR6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SrrtQ99MR6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SrrtQ99MR6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SrrtQ99MR6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SrrtQ99MR6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SrrtQ99MR6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SrrtQ99MR6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SrrtQ99MR6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SrrtQ99MR6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SrrtQ99MR6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SrrtQ99MR6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SrrtQ99MR6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SrrtQ99MR6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SrrtQ99MR6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SrrtQ99MR6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SrrtQ99MR6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SrrtQ99MR6 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SrrtQ99MR6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SrrtQ99MR6 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SrrtQ99MR6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SrrtQ99MR6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SrrtQ99MR6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SrrtQ99MR6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SrrtQ99MR6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SrrtQ99MR6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SrrtQ99MR6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SrrtQ99MR6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 202.3 ms