Protein–RNA interactions for Protein: Q99M03

Rwdd2b, RWD domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rwdd2bQ99M03 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rwdd2bQ99M03 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rwdd2bQ99M03 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rwdd2bQ99M03 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rwdd2bQ99M03 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rwdd2bQ99M03 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rwdd2bQ99M03 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rwdd2bQ99M03 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rwdd2bQ99M03 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rwdd2bQ99M03 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rwdd2bQ99M03 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rwdd2bQ99M03 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rwdd2bQ99M03 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Rwdd2bQ99M03 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rwdd2bQ99M03 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rwdd2bQ99M03 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rwdd2bQ99M03 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rwdd2bQ99M03 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rwdd2bQ99M03 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rwdd2bQ99M03 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rwdd2bQ99M03 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rwdd2bQ99M03 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rwdd2bQ99M03 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rwdd2bQ99M03 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rwdd2bQ99M03 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rwdd2bQ99M03 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rwdd2bQ99M03 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rwdd2bQ99M03 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rwdd2bQ99M03 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rwdd2bQ99M03 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rwdd2bQ99M03 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rwdd2bQ99M03 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rwdd2bQ99M03 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rwdd2bQ99M03 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rwdd2bQ99M03 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rwdd2bQ99M03 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rwdd2bQ99M03 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rwdd2bQ99M03 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rwdd2bQ99M03 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rwdd2bQ99M03 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rwdd2bQ99M03 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rwdd2bQ99M03 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rwdd2bQ99M03 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rwdd2bQ99M03 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rwdd2bQ99M03 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rwdd2bQ99M03 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rwdd2bQ99M03 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rwdd2bQ99M03 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rwdd2bQ99M03 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rwdd2bQ99M03 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rwdd2bQ99M03 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rwdd2bQ99M03 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rwdd2bQ99M03 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rwdd2bQ99M03 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rwdd2bQ99M03 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rwdd2bQ99M03 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rwdd2bQ99M03 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rwdd2bQ99M03 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rwdd2bQ99M03 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rwdd2bQ99M03 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rwdd2bQ99M03 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rwdd2bQ99M03 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rwdd2bQ99M03 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rwdd2bQ99M03 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rwdd2bQ99M03 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rwdd2bQ99M03 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rwdd2bQ99M03 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rwdd2bQ99M03 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rwdd2bQ99M03 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rwdd2bQ99M03 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rwdd2bQ99M03 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rwdd2bQ99M03 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rwdd2bQ99M03 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rwdd2bQ99M03 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rwdd2bQ99M03 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rwdd2bQ99M03 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rwdd2bQ99M03 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rwdd2bQ99M03 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rwdd2bQ99M03 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rwdd2bQ99M03 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rwdd2bQ99M03 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rwdd2bQ99M03 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rwdd2bQ99M03 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rwdd2bQ99M03 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rwdd2bQ99M03 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rwdd2bQ99M03 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rwdd2bQ99M03 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rwdd2bQ99M03 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rwdd2bQ99M03 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rwdd2bQ99M03 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rwdd2bQ99M03 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rwdd2bQ99M03 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rwdd2bQ99M03 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rwdd2bQ99M03 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rwdd2bQ99M03 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rwdd2bQ99M03 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rwdd2bQ99M03 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rwdd2bQ99M03 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rwdd2bQ99M03 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rwdd2bQ99M03 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.5 ms