Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ0

Cttnbp2nl, CTTNBP2 N-terminal-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cttnbp2nlQ99LJ0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cttnbp2nlQ99LJ0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cttnbp2nlQ99LJ0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cttnbp2nlQ99LJ0 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cttnbp2nlQ99LJ0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cttnbp2nlQ99LJ0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cttnbp2nlQ99LJ0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cttnbp2nlQ99LJ0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cttnbp2nlQ99LJ0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cttnbp2nlQ99LJ0 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cttnbp2nlQ99LJ0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Cttnbp2nlQ99LJ0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cttnbp2nlQ99LJ0 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cttnbp2nlQ99LJ0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cttnbp2nlQ99LJ0 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cttnbp2nlQ99LJ0 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Cttnbp2nlQ99LJ0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cttnbp2nlQ99LJ0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cttnbp2nlQ99LJ0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cttnbp2nlQ99LJ0 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cttnbp2nlQ99LJ0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cttnbp2nlQ99LJ0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cttnbp2nlQ99LJ0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cttnbp2nlQ99LJ0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cttnbp2nlQ99LJ0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cttnbp2nlQ99LJ0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cttnbp2nlQ99LJ0 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cttnbp2nlQ99LJ0 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Cttnbp2nlQ99LJ0 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cttnbp2nlQ99LJ0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cttnbp2nlQ99LJ0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cttnbp2nlQ99LJ0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Cttnbp2nlQ99LJ0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cttnbp2nlQ99LJ0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cttnbp2nlQ99LJ0 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cttnbp2nlQ99LJ0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cttnbp2nlQ99LJ0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cttnbp2nlQ99LJ0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cttnbp2nlQ99LJ0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cttnbp2nlQ99LJ0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cttnbp2nlQ99LJ0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Cttnbp2nlQ99LJ0 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Cttnbp2nlQ99LJ0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cttnbp2nlQ99LJ0 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cttnbp2nlQ99LJ0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cttnbp2nlQ99LJ0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cttnbp2nlQ99LJ0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cttnbp2nlQ99LJ0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Cttnbp2nlQ99LJ0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cttnbp2nlQ99LJ0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cttnbp2nlQ99LJ0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.9 ms