Protein–RNA interactions for Protein: Q99L48

Nmd3, 60S ribosomal export protein NMD3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nmd3Q99L48 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nmd3Q99L48 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nmd3Q99L48 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nmd3Q99L48 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nmd3Q99L48 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nmd3Q99L48 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nmd3Q99L48 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nmd3Q99L48 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nmd3Q99L48 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nmd3Q99L48 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nmd3Q99L48 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nmd3Q99L48 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nmd3Q99L48 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nmd3Q99L48 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nmd3Q99L48 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Nmd3Q99L48 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nmd3Q99L48 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nmd3Q99L48 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nmd3Q99L48 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nmd3Q99L48 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nmd3Q99L48 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nmd3Q99L48 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nmd3Q99L48 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nmd3Q99L48 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Nmd3Q99L48 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nmd3Q99L48 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nmd3Q99L48 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nmd3Q99L48 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nmd3Q99L48 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nmd3Q99L48 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nmd3Q99L48 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nmd3Q99L48 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nmd3Q99L48 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nmd3Q99L48 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nmd3Q99L48 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nmd3Q99L48 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nmd3Q99L48 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nmd3Q99L48 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nmd3Q99L48 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nmd3Q99L48 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nmd3Q99L48 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nmd3Q99L48 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nmd3Q99L48 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nmd3Q99L48 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nmd3Q99L48 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nmd3Q99L48 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nmd3Q99L48 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nmd3Q99L48 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nmd3Q99L48 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nmd3Q99L48 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nmd3Q99L48 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nmd3Q99L48 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nmd3Q99L48 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nmd3Q99L48 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nmd3Q99L48 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nmd3Q99L48 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Nmd3Q99L48 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Nmd3Q99L48 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nmd3Q99L48 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nmd3Q99L48 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nmd3Q99L48 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nmd3Q99L48 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nmd3Q99L48 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nmd3Q99L48 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nmd3Q99L48 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nmd3Q99L48 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nmd3Q99L48 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Nmd3Q99L48 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nmd3Q99L48 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nmd3Q99L48 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nmd3Q99L48 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nmd3Q99L48 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nmd3Q99L48 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nmd3Q99L48 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nmd3Q99L48 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nmd3Q99L48 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nmd3Q99L48 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nmd3Q99L48 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nmd3Q99L48 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nmd3Q99L48 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nmd3Q99L48 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nmd3Q99L48 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nmd3Q99L48 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nmd3Q99L48 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nmd3Q99L48 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nmd3Q99L48 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nmd3Q99L48 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nmd3Q99L48 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nmd3Q99L48 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nmd3Q99L48 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nmd3Q99L48 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nmd3Q99L48 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nmd3Q99L48 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nmd3Q99L48 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nmd3Q99L48 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nmd3Q99L48 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nmd3Q99L48 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nmd3Q99L48 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nmd3Q99L48 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nmd3Q99L48 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms