Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR3

Lactb2, Endoribonuclease LACTB2, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lactb2Q99KR3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lactb2Q99KR3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lactb2Q99KR3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lactb2Q99KR3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lactb2Q99KR3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Lactb2Q99KR3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lactb2Q99KR3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lactb2Q99KR3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lactb2Q99KR3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lactb2Q99KR3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lactb2Q99KR3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lactb2Q99KR3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lactb2Q99KR3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Lactb2Q99KR3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lactb2Q99KR3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lactb2Q99KR3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lactb2Q99KR3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lactb2Q99KR3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lactb2Q99KR3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lactb2Q99KR3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lactb2Q99KR3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lactb2Q99KR3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lactb2Q99KR3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lactb2Q99KR3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lactb2Q99KR3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lactb2Q99KR3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lactb2Q99KR3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lactb2Q99KR3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lactb2Q99KR3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lactb2Q99KR3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lactb2Q99KR3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lactb2Q99KR3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lactb2Q99KR3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lactb2Q99KR3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Lactb2Q99KR3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Lactb2Q99KR3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lactb2Q99KR3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lactb2Q99KR3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lactb2Q99KR3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lactb2Q99KR3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lactb2Q99KR3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lactb2Q99KR3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Lactb2Q99KR3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Lactb2Q99KR3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lactb2Q99KR3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lactb2Q99KR3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lactb2Q99KR3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lactb2Q99KR3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lactb2Q99KR3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lactb2Q99KR3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lactb2Q99KR3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lactb2Q99KR3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lactb2Q99KR3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Lactb2Q99KR3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Lactb2Q99KR3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lactb2Q99KR3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lactb2Q99KR3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lactb2Q99KR3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lactb2Q99KR3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lactb2Q99KR3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lactb2Q99KR3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lactb2Q99KR3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lactb2Q99KR3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lactb2Q99KR3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Lactb2Q99KR3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lactb2Q99KR3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lactb2Q99KR3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lactb2Q99KR3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lactb2Q99KR3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Lactb2Q99KR3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Lactb2Q99KR3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lactb2Q99KR3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lactb2Q99KR3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lactb2Q99KR3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lactb2Q99KR3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lactb2Q99KR3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lactb2Q99KR3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lactb2Q99KR3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lactb2Q99KR3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Lactb2Q99KR3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lactb2Q99KR3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lactb2Q99KR3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lactb2Q99KR3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Lactb2Q99KR3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lactb2Q99KR3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lactb2Q99KR3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lactb2Q99KR3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lactb2Q99KR3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lactb2Q99KR3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lactb2Q99KR3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lactb2Q99KR3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lactb2Q99KR3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lactb2Q99KR3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lactb2Q99KR3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lactb2Q99KR3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lactb2Q99KR3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lactb2Q99KR3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lactb2Q99KR3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lactb2Q99KR3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lactb2Q99KR3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms