Protein–RNA interactions for Protein: Q99KL7

Rab28, Ras-related protein Rab-28, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab28Q99KL7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rab28Q99KL7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rab28Q99KL7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rab28Q99KL7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rab28Q99KL7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rab28Q99KL7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rab28Q99KL7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rab28Q99KL7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rab28Q99KL7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rab28Q99KL7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rab28Q99KL7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rab28Q99KL7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Rab28Q99KL7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rab28Q99KL7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rab28Q99KL7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rab28Q99KL7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rab28Q99KL7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rab28Q99KL7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rab28Q99KL7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rab28Q99KL7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rab28Q99KL7 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rab28Q99KL7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Rab28Q99KL7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Rab28Q99KL7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rab28Q99KL7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rab28Q99KL7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rab28Q99KL7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Rab28Q99KL7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rab28Q99KL7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rab28Q99KL7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rab28Q99KL7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rab28Q99KL7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rab28Q99KL7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rab28Q99KL7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rab28Q99KL7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rab28Q99KL7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rab28Q99KL7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Rab28Q99KL7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rab28Q99KL7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rab28Q99KL7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rab28Q99KL7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rab28Q99KL7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Rab28Q99KL7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rab28Q99KL7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rab28Q99KL7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rab28Q99KL7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rab28Q99KL7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Rab28Q99KL7 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rab28Q99KL7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rab28Q99KL7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rab28Q99KL7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rab28Q99KL7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Rab28Q99KL7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rab28Q99KL7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rab28Q99KL7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rab28Q99KL7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rab28Q99KL7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rab28Q99KL7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rab28Q99KL7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rab28Q99KL7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rab28Q99KL7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Rab28Q99KL7 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rab28Q99KL7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rab28Q99KL7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rab28Q99KL7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rab28Q99KL7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rab28Q99KL7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rab28Q99KL7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rab28Q99KL7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rab28Q99KL7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Rab28Q99KL7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rab28Q99KL7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rab28Q99KL7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rab28Q99KL7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rab28Q99KL7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rab28Q99KL7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Rab28Q99KL7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rab28Q99KL7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rab28Q99KL7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rab28Q99KL7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rab28Q99KL7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rab28Q99KL7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rab28Q99KL7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rab28Q99KL7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rab28Q99KL7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rab28Q99KL7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rab28Q99KL7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rab28Q99KL7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rab28Q99KL7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rab28Q99KL7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Rab28Q99KL7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rab28Q99KL7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rab28Q99KL7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rab28Q99KL7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rab28Q99KL7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rab28Q99KL7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rab28Q99KL7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rab28Q99KL7 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rab28Q99KL7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rab28Q99KL7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms