Protein–RNA interactions for Protein: Q99JP6

Homer3, Homer protein homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer3Q99JP6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Homer3Q99JP6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Homer3Q99JP6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Homer3Q99JP6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Homer3Q99JP6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Homer3Q99JP6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Homer3Q99JP6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Homer3Q99JP6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Homer3Q99JP6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Homer3Q99JP6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Homer3Q99JP6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Homer3Q99JP6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Homer3Q99JP6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Homer3Q99JP6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Homer3Q99JP6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Homer3Q99JP6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Homer3Q99JP6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Homer3Q99JP6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Homer3Q99JP6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Homer3Q99JP6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Homer3Q99JP6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Homer3Q99JP6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Homer3Q99JP6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Homer3Q99JP6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Homer3Q99JP6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Homer3Q99JP6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Homer3Q99JP6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Homer3Q99JP6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Homer3Q99JP6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Homer3Q99JP6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Homer3Q99JP6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Homer3Q99JP6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Homer3Q99JP6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Homer3Q99JP6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Homer3Q99JP6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Homer3Q99JP6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Homer3Q99JP6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Homer3Q99JP6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Homer3Q99JP6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Homer3Q99JP6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Homer3Q99JP6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Homer3Q99JP6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Homer3Q99JP6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Homer3Q99JP6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Homer3Q99JP6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Homer3Q99JP6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Homer3Q99JP6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Homer3Q99JP6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Homer3Q99JP6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Homer3Q99JP6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Homer3Q99JP6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Homer3Q99JP6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Homer3Q99JP6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Homer3Q99JP6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Homer3Q99JP6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Homer3Q99JP6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Homer3Q99JP6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Homer3Q99JP6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Homer3Q99JP6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Homer3Q99JP6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Homer3Q99JP6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Homer3Q99JP6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Homer3Q99JP6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Homer3Q99JP6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Homer3Q99JP6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Homer3Q99JP6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Homer3Q99JP6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Homer3Q99JP6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Homer3Q99JP6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Homer3Q99JP6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Homer3Q99JP6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Homer3Q99JP6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Homer3Q99JP6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Homer3Q99JP6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Homer3Q99JP6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Homer3Q99JP6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Homer3Q99JP6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Homer3Q99JP6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Homer3Q99JP6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Homer3Q99JP6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Homer3Q99JP6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Homer3Q99JP6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Homer3Q99JP6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Homer3Q99JP6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Homer3Q99JP6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Homer3Q99JP6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Homer3Q99JP6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Homer3Q99JP6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Homer3Q99JP6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Homer3Q99JP6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Homer3Q99JP6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Homer3Q99JP6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Homer3Q99JP6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Homer3Q99JP6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Homer3Q99JP6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Homer3Q99JP6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Homer3Q99JP6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Homer3Q99JP6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Homer3Q99JP6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Homer3Q99JP6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 145.3 ms