Protein–RNA interactions for Protein: Q99JI4

Psmd6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd6Q99JI4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Psmd6Q99JI4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Psmd6Q99JI4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Psmd6Q99JI4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Psmd6Q99JI4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Psmd6Q99JI4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Psmd6Q99JI4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Psmd6Q99JI4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Psmd6Q99JI4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Psmd6Q99JI4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Psmd6Q99JI4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Psmd6Q99JI4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Psmd6Q99JI4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Psmd6Q99JI4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Psmd6Q99JI4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Psmd6Q99JI4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Psmd6Q99JI4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Psmd6Q99JI4 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Psmd6Q99JI4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Psmd6Q99JI4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Psmd6Q99JI4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Psmd6Q99JI4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Psmd6Q99JI4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Psmd6Q99JI4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Psmd6Q99JI4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Psmd6Q99JI4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Psmd6Q99JI4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Psmd6Q99JI4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Psmd6Q99JI4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Psmd6Q99JI4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Psmd6Q99JI4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Psmd6Q99JI4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Psmd6Q99JI4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Psmd6Q99JI4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Psmd6Q99JI4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Psmd6Q99JI4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Psmd6Q99JI4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Psmd6Q99JI4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Psmd6Q99JI4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Psmd6Q99JI4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Psmd6Q99JI4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Psmd6Q99JI4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Psmd6Q99JI4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Psmd6Q99JI4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Psmd6Q99JI4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Psmd6Q99JI4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Psmd6Q99JI4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Psmd6Q99JI4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Psmd6Q99JI4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Psmd6Q99JI4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Psmd6Q99JI4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Psmd6Q99JI4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Psmd6Q99JI4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Psmd6Q99JI4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Psmd6Q99JI4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Psmd6Q99JI4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Psmd6Q99JI4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Psmd6Q99JI4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Psmd6Q99JI4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Psmd6Q99JI4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Psmd6Q99JI4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Psmd6Q99JI4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Psmd6Q99JI4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Psmd6Q99JI4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Psmd6Q99JI4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Psmd6Q99JI4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Psmd6Q99JI4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Psmd6Q99JI4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Psmd6Q99JI4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Psmd6Q99JI4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Psmd6Q99JI4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Psmd6Q99JI4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Psmd6Q99JI4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Psmd6Q99JI4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Psmd6Q99JI4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Psmd6Q99JI4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Psmd6Q99JI4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Psmd6Q99JI4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Psmd6Q99JI4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Psmd6Q99JI4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Psmd6Q99JI4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Psmd6Q99JI4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Psmd6Q99JI4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Psmd6Q99JI4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Psmd6Q99JI4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Psmd6Q99JI4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Psmd6Q99JI4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Psmd6Q99JI4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Psmd6Q99JI4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Psmd6Q99JI4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Psmd6Q99JI4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Psmd6Q99JI4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Psmd6Q99JI4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Psmd6Q99JI4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Psmd6Q99JI4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Psmd6Q99JI4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Psmd6Q99JI4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Psmd6Q99JI4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Psmd6Q99JI4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Psmd6Q99JI4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms