Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Csmd1Q923L3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Csmd1Q923L3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Csmd1Q923L3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
Csmd1Q923L3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Csmd1Q923L3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Csmd1Q923L3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Csmd1Q923L3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Csmd1Q923L3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Csmd1Q923L3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Csmd1Q923L3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Csmd1Q923L3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Csmd1Q923L3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Csmd1Q923L3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Csmd1Q923L3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Csmd1Q923L3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Csmd1Q923L3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Csmd1Q923L3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Csmd1Q923L3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Csmd1Q923L3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Csmd1Q923L3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Csmd1Q923L3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Csmd1Q923L3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Csmd1Q923L3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Csmd1Q923L3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Csmd1Q923L3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Csmd1Q923L3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Csmd1Q923L3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Csmd1Q923L3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Csmd1Q923L3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Csmd1Q923L3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Csmd1Q923L3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Csmd1Q923L3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Csmd1Q923L3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Csmd1Q923L3 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Csmd1Q923L3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Csmd1Q923L3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Csmd1Q923L3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Csmd1Q923L3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Csmd1Q923L3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Csmd1Q923L3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Csmd1Q923L3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Csmd1Q923L3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Csmd1Q923L3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Csmd1Q923L3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Csmd1Q923L3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Csmd1Q923L3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Csmd1Q923L3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Csmd1Q923L3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Csmd1Q923L3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Csmd1Q923L3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Csmd1Q923L3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Csmd1Q923L3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Csmd1Q923L3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Csmd1Q923L3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Csmd1Q923L3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Csmd1Q923L3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Csmd1Q923L3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Csmd1Q923L3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Csmd1Q923L3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20■□□□□ 0.79
Csmd1Q923L3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Csmd1Q923L3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Csmd1Q923L3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Csmd1Q923L3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Csmd1Q923L3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Csmd1Q923L3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Csmd1Q923L3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Csmd1Q923L3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Csmd1Q923L3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Csmd1Q923L3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Csmd1Q923L3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Csmd1Q923L3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Csmd1Q923L3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Csmd1Q923L3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Csmd1Q923L3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Csmd1Q923L3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Csmd1Q923L3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Csmd1Q923L3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Csmd1Q923L3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Csmd1Q923L3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Csmd1Q923L3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Csmd1Q923L3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Csmd1Q923L3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Csmd1Q923L3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Csmd1Q923L3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Csmd1Q923L3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Csmd1Q923L3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Csmd1Q923L3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Csmd1Q923L3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Csmd1Q923L3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Csmd1Q923L3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Csmd1Q923L3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Csmd1Q923L3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Csmd1Q923L3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Csmd1Q923L3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Csmd1Q923L3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Csmd1Q923L3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Csmd1Q923L3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Csmd1Q923L3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Csmd1Q923L3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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