Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZZ3

Sncb, Beta-synuclein, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SncbQ91ZZ3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SncbQ91ZZ3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SncbQ91ZZ3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SncbQ91ZZ3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SncbQ91ZZ3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SncbQ91ZZ3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SncbQ91ZZ3 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SncbQ91ZZ3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SncbQ91ZZ3 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SncbQ91ZZ3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SncbQ91ZZ3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SncbQ91ZZ3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SncbQ91ZZ3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SncbQ91ZZ3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SncbQ91ZZ3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SncbQ91ZZ3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SncbQ91ZZ3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SncbQ91ZZ3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SncbQ91ZZ3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SncbQ91ZZ3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SncbQ91ZZ3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SncbQ91ZZ3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SncbQ91ZZ3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SncbQ91ZZ3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SncbQ91ZZ3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SncbQ91ZZ3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SncbQ91ZZ3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SncbQ91ZZ3 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SncbQ91ZZ3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SncbQ91ZZ3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SncbQ91ZZ3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SncbQ91ZZ3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SncbQ91ZZ3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SncbQ91ZZ3 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SncbQ91ZZ3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SncbQ91ZZ3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SncbQ91ZZ3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SncbQ91ZZ3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SncbQ91ZZ3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SncbQ91ZZ3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SncbQ91ZZ3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SncbQ91ZZ3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SncbQ91ZZ3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SncbQ91ZZ3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SncbQ91ZZ3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SncbQ91ZZ3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SncbQ91ZZ3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SncbQ91ZZ3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SncbQ91ZZ3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SncbQ91ZZ3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SncbQ91ZZ3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SncbQ91ZZ3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SncbQ91ZZ3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SncbQ91ZZ3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SncbQ91ZZ3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SncbQ91ZZ3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SncbQ91ZZ3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SncbQ91ZZ3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SncbQ91ZZ3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SncbQ91ZZ3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SncbQ91ZZ3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SncbQ91ZZ3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SncbQ91ZZ3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SncbQ91ZZ3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SncbQ91ZZ3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SncbQ91ZZ3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SncbQ91ZZ3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SncbQ91ZZ3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SncbQ91ZZ3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SncbQ91ZZ3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SncbQ91ZZ3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SncbQ91ZZ3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SncbQ91ZZ3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SncbQ91ZZ3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SncbQ91ZZ3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SncbQ91ZZ3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SncbQ91ZZ3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SncbQ91ZZ3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SncbQ91ZZ3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SncbQ91ZZ3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SncbQ91ZZ3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SncbQ91ZZ3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SncbQ91ZZ3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SncbQ91ZZ3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SncbQ91ZZ3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SncbQ91ZZ3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SncbQ91ZZ3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SncbQ91ZZ3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SncbQ91ZZ3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SncbQ91ZZ3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SncbQ91ZZ3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SncbQ91ZZ3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SncbQ91ZZ3 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SncbQ91ZZ3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SncbQ91ZZ3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SncbQ91ZZ3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SncbQ91ZZ3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SncbQ91ZZ3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SncbQ91ZZ3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SncbQ91ZZ3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms