Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZW3

Smarca5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca5Q91ZW3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Smarca5Q91ZW3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Smarca5Q91ZW3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Smarca5Q91ZW3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Smarca5Q91ZW3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Smarca5Q91ZW3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Smarca5Q91ZW3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Smarca5Q91ZW3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Smarca5Q91ZW3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Smarca5Q91ZW3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Smarca5Q91ZW3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Smarca5Q91ZW3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Smarca5Q91ZW3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Smarca5Q91ZW3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Smarca5Q91ZW3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Smarca5Q91ZW3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Smarca5Q91ZW3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Smarca5Q91ZW3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Smarca5Q91ZW3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Smarca5Q91ZW3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Smarca5Q91ZW3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Smarca5Q91ZW3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Smarca5Q91ZW3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Smarca5Q91ZW3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Smarca5Q91ZW3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Smarca5Q91ZW3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Smarca5Q91ZW3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Smarca5Q91ZW3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Smarca5Q91ZW3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Smarca5Q91ZW3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Smarca5Q91ZW3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Smarca5Q91ZW3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Smarca5Q91ZW3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Smarca5Q91ZW3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Smarca5Q91ZW3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Smarca5Q91ZW3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Smarca5Q91ZW3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Smarca5Q91ZW3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Smarca5Q91ZW3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Smarca5Q91ZW3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Smarca5Q91ZW3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Smarca5Q91ZW3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Smarca5Q91ZW3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Smarca5Q91ZW3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Smarca5Q91ZW3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Smarca5Q91ZW3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Smarca5Q91ZW3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Smarca5Q91ZW3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Smarca5Q91ZW3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Smarca5Q91ZW3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Smarca5Q91ZW3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Smarca5Q91ZW3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Smarca5Q91ZW3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Smarca5Q91ZW3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Smarca5Q91ZW3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Smarca5Q91ZW3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Smarca5Q91ZW3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Smarca5Q91ZW3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Smarca5Q91ZW3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Smarca5Q91ZW3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Smarca5Q91ZW3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Smarca5Q91ZW3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Smarca5Q91ZW3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Smarca5Q91ZW3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Smarca5Q91ZW3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Smarca5Q91ZW3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Smarca5Q91ZW3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Smarca5Q91ZW3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Smarca5Q91ZW3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Smarca5Q91ZW3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Smarca5Q91ZW3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Smarca5Q91ZW3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Smarca5Q91ZW3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Smarca5Q91ZW3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Smarca5Q91ZW3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Smarca5Q91ZW3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Smarca5Q91ZW3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Smarca5Q91ZW3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Smarca5Q91ZW3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Smarca5Q91ZW3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Smarca5Q91ZW3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Smarca5Q91ZW3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Smarca5Q91ZW3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Smarca5Q91ZW3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Smarca5Q91ZW3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Smarca5Q91ZW3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Smarca5Q91ZW3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Smarca5Q91ZW3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Smarca5Q91ZW3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Smarca5Q91ZW3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Smarca5Q91ZW3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Smarca5Q91ZW3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Smarca5Q91ZW3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Smarca5Q91ZW3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Smarca5Q91ZW3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Smarca5Q91ZW3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Smarca5Q91ZW3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Smarca5Q91ZW3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Smarca5Q91ZW3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Smarca5Q91ZW3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms