Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZD5

Cts3, Cathepsin-3, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cts3Q91ZD5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cts3Q91ZD5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cts3Q91ZD5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cts3Q91ZD5 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cts3Q91ZD5 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cts3Q91ZD5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cts3Q91ZD5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cts3Q91ZD5 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cts3Q91ZD5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cts3Q91ZD5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cts3Q91ZD5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cts3Q91ZD5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cts3Q91ZD5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cts3Q91ZD5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Cts3Q91ZD5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cts3Q91ZD5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cts3Q91ZD5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cts3Q91ZD5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Cts3Q91ZD5 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cts3Q91ZD5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cts3Q91ZD5 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cts3Q91ZD5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cts3Q91ZD5 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Cts3Q91ZD5 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cts3Q91ZD5 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cts3Q91ZD5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cts3Q91ZD5 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cts3Q91ZD5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cts3Q91ZD5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cts3Q91ZD5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cts3Q91ZD5 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Cts3Q91ZD5 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Cts3Q91ZD5 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cts3Q91ZD5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cts3Q91ZD5 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Cts3Q91ZD5 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Cts3Q91ZD5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cts3Q91ZD5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cts3Q91ZD5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cts3Q91ZD5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cts3Q91ZD5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cts3Q91ZD5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cts3Q91ZD5 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cts3Q91ZD5 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cts3Q91ZD5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cts3Q91ZD5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cts3Q91ZD5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cts3Q91ZD5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cts3Q91ZD5 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cts3Q91ZD5 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cts3Q91ZD5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Cts3Q91ZD5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Cts3Q91ZD5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cts3Q91ZD5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cts3Q91ZD5 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cts3Q91ZD5 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cts3Q91ZD5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cts3Q91ZD5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cts3Q91ZD5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cts3Q91ZD5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cts3Q91ZD5 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Cts3Q91ZD5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cts3Q91ZD5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cts3Q91ZD5 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cts3Q91ZD5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cts3Q91ZD5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cts3Q91ZD5 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cts3Q91ZD5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cts3Q91ZD5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cts3Q91ZD5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cts3Q91ZD5 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cts3Q91ZD5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cts3Q91ZD5 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cts3Q91ZD5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Cts3Q91ZD5 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cts3Q91ZD5 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cts3Q91ZD5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cts3Q91ZD5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Cts3Q91ZD5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cts3Q91ZD5 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cts3Q91ZD5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cts3Q91ZD5 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Cts3Q91ZD5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cts3Q91ZD5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cts3Q91ZD5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cts3Q91ZD5 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cts3Q91ZD5 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cts3Q91ZD5 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cts3Q91ZD5 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cts3Q91ZD5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cts3Q91ZD5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cts3Q91ZD5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cts3Q91ZD5 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cts3Q91ZD5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cts3Q91ZD5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cts3Q91ZD5 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Cts3Q91ZD5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cts3Q91ZD5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cts3Q91ZD5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cts3Q91ZD5 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 157.1 ms