Protein–RNA interactions for Protein: Q91Z69

Srgap1, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,062 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srgap1Q91Z69 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Srgap1Q91Z69 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Srgap1Q91Z69 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Srgap1Q91Z69 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Srgap1Q91Z69 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Srgap1Q91Z69 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Srgap1Q91Z69 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Srgap1Q91Z69 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Srgap1Q91Z69 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Srgap1Q91Z69 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Srgap1Q91Z69 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Srgap1Q91Z69 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Srgap1Q91Z69 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Srgap1Q91Z69 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Srgap1Q91Z69 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Srgap1Q91Z69 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Srgap1Q91Z69 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Srgap1Q91Z69 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Srgap1Q91Z69 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Srgap1Q91Z69 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Srgap1Q91Z69 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Srgap1Q91Z69 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Srgap1Q91Z69 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Srgap1Q91Z69 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Srgap1Q91Z69 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Srgap1Q91Z69 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Srgap1Q91Z69 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Srgap1Q91Z69 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Srgap1Q91Z69 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Srgap1Q91Z69 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Srgap1Q91Z69 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Srgap1Q91Z69 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Srgap1Q91Z69 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Srgap1Q91Z69 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Srgap1Q91Z69 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Srgap1Q91Z69 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Srgap1Q91Z69 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Srgap1Q91Z69 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Srgap1Q91Z69 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Srgap1Q91Z69 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Srgap1Q91Z69 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Srgap1Q91Z69 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Srgap1Q91Z69 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Srgap1Q91Z69 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Srgap1Q91Z69 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Srgap1Q91Z69 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Srgap1Q91Z69 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Srgap1Q91Z69 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Srgap1Q91Z69 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Srgap1Q91Z69 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Srgap1Q91Z69 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Srgap1Q91Z69 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Srgap1Q91Z69 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Srgap1Q91Z69 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Srgap1Q91Z69 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Srgap1Q91Z69 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Srgap1Q91Z69 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Srgap1Q91Z69 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Srgap1Q91Z69 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Srgap1Q91Z69 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Srgap1Q91Z69 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Srgap1Q91Z69 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Srgap1Q91Z69 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Srgap1Q91Z69 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Srgap1Q91Z69 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Srgap1Q91Z69 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Srgap1Q91Z69 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Srgap1Q91Z69 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Srgap1Q91Z69 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Srgap1Q91Z69 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Srgap1Q91Z69 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Srgap1Q91Z69 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Srgap1Q91Z69 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Srgap1Q91Z69 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Srgap1Q91Z69 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Srgap1Q91Z69 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Srgap1Q91Z69 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Srgap1Q91Z69 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Srgap1Q91Z69 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Srgap1Q91Z69 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Srgap1Q91Z69 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Srgap1Q91Z69 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Srgap1Q91Z69 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Srgap1Q91Z69 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Srgap1Q91Z69 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Srgap1Q91Z69 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Srgap1Q91Z69 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Srgap1Q91Z69 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Srgap1Q91Z69 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Srgap1Q91Z69 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Srgap1Q91Z69 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Srgap1Q91Z69 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Srgap1Q91Z69 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Srgap1Q91Z69 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Srgap1Q91Z69 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Srgap1Q91Z69 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Srgap1Q91Z69 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Srgap1Q91Z69 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Srgap1Q91Z69 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Srgap1Q91Z69 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms