Protein–RNA interactions for Protein: Q91YK0

Lrrc49, Leucine-rich repeat-containing protein 49, mousemouse

Predictions only

Length 686 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc49Q91YK0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrrc49Q91YK0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrrc49Q91YK0 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrrc49Q91YK0 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrrc49Q91YK0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrrc49Q91YK0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrrc49Q91YK0 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrrc49Q91YK0 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrrc49Q91YK0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrrc49Q91YK0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrrc49Q91YK0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrrc49Q91YK0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrrc49Q91YK0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrrc49Q91YK0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrrc49Q91YK0 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lrrc49Q91YK0 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lrrc49Q91YK0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lrrc49Q91YK0 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrrc49Q91YK0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrrc49Q91YK0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrrc49Q91YK0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrrc49Q91YK0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrrc49Q91YK0 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrrc49Q91YK0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrrc49Q91YK0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrrc49Q91YK0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrrc49Q91YK0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrrc49Q91YK0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrrc49Q91YK0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrrc49Q91YK0 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrrc49Q91YK0 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrrc49Q91YK0 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrrc49Q91YK0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrrc49Q91YK0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrrc49Q91YK0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrrc49Q91YK0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrrc49Q91YK0 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrrc49Q91YK0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrrc49Q91YK0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrrc49Q91YK0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrrc49Q91YK0 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrrc49Q91YK0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrrc49Q91YK0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrrc49Q91YK0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrrc49Q91YK0 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrrc49Q91YK0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrrc49Q91YK0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrrc49Q91YK0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lrrc49Q91YK0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lrrc49Q91YK0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lrrc49Q91YK0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lrrc49Q91YK0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Lrrc49Q91YK0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lrrc49Q91YK0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrrc49Q91YK0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrrc49Q91YK0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrrc49Q91YK0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrrc49Q91YK0 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrrc49Q91YK0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrrc49Q91YK0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrrc49Q91YK0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrrc49Q91YK0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrrc49Q91YK0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrrc49Q91YK0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrrc49Q91YK0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrrc49Q91YK0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrrc49Q91YK0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Lrrc49Q91YK0 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lrrc49Q91YK0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lrrc49Q91YK0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lrrc49Q91YK0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lrrc49Q91YK0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lrrc49Q91YK0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lrrc49Q91YK0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lrrc49Q91YK0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lrrc49Q91YK0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrrc49Q91YK0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrrc49Q91YK0 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lrrc49Q91YK0 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lrrc49Q91YK0 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lrrc49Q91YK0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrrc49Q91YK0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrrc49Q91YK0 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrrc49Q91YK0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrrc49Q91YK0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrrc49Q91YK0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrrc49Q91YK0 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrrc49Q91YK0 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrrc49Q91YK0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrrc49Q91YK0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lrrc49Q91YK0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lrrc49Q91YK0 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lrrc49Q91YK0 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lrrc49Q91YK0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lrrc49Q91YK0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrrc49Q91YK0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrrc49Q91YK0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrrc49Q91YK0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrrc49Q91YK0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrrc49Q91YK0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms