Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y21

Pcdha1, Protocadherin alpha 1, mousemouse

Predictions only

Length 948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdha1Q91Y21 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Pcdha1Q91Y21 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pcdha1Q91Y21 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pcdha1Q91Y21 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pcdha1Q91Y21 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pcdha1Q91Y21 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pcdha1Q91Y21 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pcdha1Q91Y21 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pcdha1Q91Y21 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pcdha1Q91Y21 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pcdha1Q91Y21 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pcdha1Q91Y21 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pcdha1Q91Y21 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pcdha1Q91Y21 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pcdha1Q91Y21 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pcdha1Q91Y21 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pcdha1Q91Y21 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pcdha1Q91Y21 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pcdha1Q91Y21 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pcdha1Q91Y21 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pcdha1Q91Y21 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pcdha1Q91Y21 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pcdha1Q91Y21 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pcdha1Q91Y21 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pcdha1Q91Y21 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pcdha1Q91Y21 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Pcdha1Q91Y21 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pcdha1Q91Y21 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pcdha1Q91Y21 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pcdha1Q91Y21 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pcdha1Q91Y21 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pcdha1Q91Y21 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pcdha1Q91Y21 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pcdha1Q91Y21 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pcdha1Q91Y21 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pcdha1Q91Y21 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pcdha1Q91Y21 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pcdha1Q91Y21 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Pcdha1Q91Y21 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pcdha1Q91Y21 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Pcdha1Q91Y21 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pcdha1Q91Y21 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pcdha1Q91Y21 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pcdha1Q91Y21 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pcdha1Q91Y21 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Pcdha1Q91Y21 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pcdha1Q91Y21 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pcdha1Q91Y21 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pcdha1Q91Y21 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pcdha1Q91Y21 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pcdha1Q91Y21 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pcdha1Q91Y21 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pcdha1Q91Y21 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pcdha1Q91Y21 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pcdha1Q91Y21 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Pcdha1Q91Y21 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pcdha1Q91Y21 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pcdha1Q91Y21 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pcdha1Q91Y21 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pcdha1Q91Y21 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pcdha1Q91Y21 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Pcdha1Q91Y21 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pcdha1Q91Y21 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Pcdha1Q91Y21 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pcdha1Q91Y21 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Pcdha1Q91Y21 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Pcdha1Q91Y21 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pcdha1Q91Y21 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pcdha1Q91Y21 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Pcdha1Q91Y21 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pcdha1Q91Y21 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Pcdha1Q91Y21 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pcdha1Q91Y21 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pcdha1Q91Y21 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pcdha1Q91Y21 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pcdha1Q91Y21 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pcdha1Q91Y21 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pcdha1Q91Y21 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pcdha1Q91Y21 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pcdha1Q91Y21 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Pcdha1Q91Y21 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pcdha1Q91Y21 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pcdha1Q91Y21 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Pcdha1Q91Y21 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Pcdha1Q91Y21 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcdha1Q91Y21 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcdha1Q91Y21 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcdha1Q91Y21 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcdha1Q91Y21 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcdha1Q91Y21 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcdha1Q91Y21 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcdha1Q91Y21 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcdha1Q91Y21 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcdha1Q91Y21 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pcdha1Q91Y21 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pcdha1Q91Y21 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pcdha1Q91Y21 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pcdha1Q91Y21 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pcdha1Q91Y21 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pcdha1Q91Y21 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms