Protein–RNA interactions for Protein: Q91XL2

Lnx2, Ligand of Numb protein X 2, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx2Q91XL2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lnx2Q91XL2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lnx2Q91XL2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lnx2Q91XL2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lnx2Q91XL2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lnx2Q91XL2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lnx2Q91XL2 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lnx2Q91XL2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Lnx2Q91XL2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lnx2Q91XL2 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Lnx2Q91XL2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lnx2Q91XL2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lnx2Q91XL2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lnx2Q91XL2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lnx2Q91XL2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lnx2Q91XL2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Lnx2Q91XL2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Lnx2Q91XL2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lnx2Q91XL2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lnx2Q91XL2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lnx2Q91XL2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lnx2Q91XL2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lnx2Q91XL2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lnx2Q91XL2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lnx2Q91XL2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lnx2Q91XL2 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Lnx2Q91XL2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lnx2Q91XL2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lnx2Q91XL2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Lnx2Q91XL2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lnx2Q91XL2 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lnx2Q91XL2 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lnx2Q91XL2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Lnx2Q91XL2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lnx2Q91XL2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lnx2Q91XL2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Lnx2Q91XL2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Lnx2Q91XL2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lnx2Q91XL2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lnx2Q91XL2 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lnx2Q91XL2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lnx2Q91XL2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lnx2Q91XL2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Lnx2Q91XL2 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lnx2Q91XL2 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lnx2Q91XL2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lnx2Q91XL2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lnx2Q91XL2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lnx2Q91XL2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lnx2Q91XL2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lnx2Q91XL2 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Lnx2Q91XL2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lnx2Q91XL2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Lnx2Q91XL2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lnx2Q91XL2 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lnx2Q91XL2 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lnx2Q91XL2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lnx2Q91XL2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lnx2Q91XL2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Lnx2Q91XL2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lnx2Q91XL2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lnx2Q91XL2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lnx2Q91XL2 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lnx2Q91XL2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lnx2Q91XL2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
Lnx2Q91XL2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lnx2Q91XL2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lnx2Q91XL2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lnx2Q91XL2 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Lnx2Q91XL2 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lnx2Q91XL2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lnx2Q91XL2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lnx2Q91XL2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Lnx2Q91XL2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lnx2Q91XL2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lnx2Q91XL2 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Lnx2Q91XL2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Lnx2Q91XL2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lnx2Q91XL2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Lnx2Q91XL2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lnx2Q91XL2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lnx2Q91XL2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lnx2Q91XL2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lnx2Q91XL2 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Lnx2Q91XL2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lnx2Q91XL2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lnx2Q91XL2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lnx2Q91XL2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lnx2Q91XL2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Lnx2Q91XL2 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Lnx2Q91XL2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Lnx2Q91XL2 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Lnx2Q91XL2 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lnx2Q91XL2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lnx2Q91XL2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Lnx2Q91XL2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lnx2Q91XL2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lnx2Q91XL2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lnx2Q91XL2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lnx2Q91XL2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms