Protein–RNA interactions for Protein: Q91WM3

Rrp9, U3 small nucleolar RNA-interacting protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp9Q91WM3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rrp9Q91WM3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rrp9Q91WM3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rrp9Q91WM3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rrp9Q91WM3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rrp9Q91WM3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rrp9Q91WM3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rrp9Q91WM3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rrp9Q91WM3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rrp9Q91WM3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rrp9Q91WM3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rrp9Q91WM3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rrp9Q91WM3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rrp9Q91WM3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rrp9Q91WM3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rrp9Q91WM3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rrp9Q91WM3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rrp9Q91WM3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rrp9Q91WM3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rrp9Q91WM3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Rrp9Q91WM3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
Rrp9Q91WM3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rrp9Q91WM3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rrp9Q91WM3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rrp9Q91WM3 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rrp9Q91WM3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rrp9Q91WM3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rrp9Q91WM3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rrp9Q91WM3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rrp9Q91WM3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rrp9Q91WM3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rrp9Q91WM3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rrp9Q91WM3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rrp9Q91WM3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rrp9Q91WM3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rrp9Q91WM3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rrp9Q91WM3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rrp9Q91WM3 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rrp9Q91WM3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rrp9Q91WM3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rrp9Q91WM3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rrp9Q91WM3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rrp9Q91WM3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rrp9Q91WM3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rrp9Q91WM3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rrp9Q91WM3 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Rrp9Q91WM3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rrp9Q91WM3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rrp9Q91WM3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rrp9Q91WM3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rrp9Q91WM3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rrp9Q91WM3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rrp9Q91WM3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rrp9Q91WM3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rrp9Q91WM3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rrp9Q91WM3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rrp9Q91WM3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rrp9Q91WM3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Rrp9Q91WM3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Rrp9Q91WM3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
Rrp9Q91WM3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rrp9Q91WM3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rrp9Q91WM3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rrp9Q91WM3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rrp9Q91WM3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rrp9Q91WM3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rrp9Q91WM3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rrp9Q91WM3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rrp9Q91WM3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rrp9Q91WM3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rrp9Q91WM3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rrp9Q91WM3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rrp9Q91WM3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rrp9Q91WM3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rrp9Q91WM3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rrp9Q91WM3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rrp9Q91WM3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rrp9Q91WM3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rrp9Q91WM3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Rrp9Q91WM3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Rrp9Q91WM3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Rrp9Q91WM3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rrp9Q91WM3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rrp9Q91WM3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Rrp9Q91WM3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rrp9Q91WM3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rrp9Q91WM3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rrp9Q91WM3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rrp9Q91WM3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rrp9Q91WM3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rrp9Q91WM3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rrp9Q91WM3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rrp9Q91WM3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rrp9Q91WM3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rrp9Q91WM3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rrp9Q91WM3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rrp9Q91WM3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rrp9Q91WM3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Rrp9Q91WM3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rrp9Q91WM3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms