Protein–RNA interactions for Protein: Q91WL6

Snx11, Sorting nexin-11, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx11Q91WL6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Snx11Q91WL6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snx11Q91WL6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snx11Q91WL6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snx11Q91WL6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snx11Q91WL6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snx11Q91WL6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Snx11Q91WL6 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snx11Q91WL6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snx11Q91WL6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snx11Q91WL6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snx11Q91WL6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snx11Q91WL6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snx11Q91WL6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snx11Q91WL6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snx11Q91WL6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snx11Q91WL6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snx11Q91WL6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snx11Q91WL6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Snx11Q91WL6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snx11Q91WL6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snx11Q91WL6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snx11Q91WL6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snx11Q91WL6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snx11Q91WL6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snx11Q91WL6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snx11Q91WL6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snx11Q91WL6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snx11Q91WL6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snx11Q91WL6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snx11Q91WL6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snx11Q91WL6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snx11Q91WL6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snx11Q91WL6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snx11Q91WL6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snx11Q91WL6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snx11Q91WL6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snx11Q91WL6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snx11Q91WL6 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Snx11Q91WL6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snx11Q91WL6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snx11Q91WL6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snx11Q91WL6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snx11Q91WL6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Snx11Q91WL6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snx11Q91WL6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snx11Q91WL6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snx11Q91WL6 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Snx11Q91WL6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snx11Q91WL6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snx11Q91WL6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snx11Q91WL6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snx11Q91WL6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snx11Q91WL6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snx11Q91WL6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snx11Q91WL6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snx11Q91WL6 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snx11Q91WL6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Snx11Q91WL6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snx11Q91WL6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snx11Q91WL6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snx11Q91WL6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snx11Q91WL6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snx11Q91WL6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snx11Q91WL6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snx11Q91WL6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snx11Q91WL6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snx11Q91WL6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snx11Q91WL6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snx11Q91WL6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snx11Q91WL6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snx11Q91WL6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snx11Q91WL6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snx11Q91WL6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snx11Q91WL6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snx11Q91WL6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snx11Q91WL6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snx11Q91WL6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snx11Q91WL6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snx11Q91WL6 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Snx11Q91WL6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Snx11Q91WL6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Snx11Q91WL6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snx11Q91WL6 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Snx11Q91WL6 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Snx11Q91WL6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snx11Q91WL6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snx11Q91WL6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snx11Q91WL6 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snx11Q91WL6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snx11Q91WL6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snx11Q91WL6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Snx11Q91WL6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Snx11Q91WL6 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snx11Q91WL6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snx11Q91WL6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snx11Q91WL6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snx11Q91WL6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snx11Q91WL6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snx11Q91WL6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms