Protein–RNA interactions for Protein: Q91VH2

Snx9, Sorting nexin-9, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx9Q91VH2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Snx9Q91VH2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Snx9Q91VH2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Snx9Q91VH2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Snx9Q91VH2 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Snx9Q91VH2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Snx9Q91VH2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Snx9Q91VH2 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Snx9Q91VH2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Snx9Q91VH2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Snx9Q91VH2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Snx9Q91VH2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Snx9Q91VH2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Snx9Q91VH2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Snx9Q91VH2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Snx9Q91VH2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Snx9Q91VH2 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Snx9Q91VH2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Snx9Q91VH2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Snx9Q91VH2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Snx9Q91VH2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Snx9Q91VH2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Snx9Q91VH2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Snx9Q91VH2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Snx9Q91VH2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Snx9Q91VH2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Snx9Q91VH2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Snx9Q91VH2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Snx9Q91VH2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Snx9Q91VH2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Snx9Q91VH2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Snx9Q91VH2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Snx9Q91VH2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Snx9Q91VH2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Snx9Q91VH2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Snx9Q91VH2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Snx9Q91VH2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Snx9Q91VH2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Snx9Q91VH2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Snx9Q91VH2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Snx9Q91VH2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Snx9Q91VH2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Snx9Q91VH2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Snx9Q91VH2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Snx9Q91VH2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Snx9Q91VH2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Snx9Q91VH2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Snx9Q91VH2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Snx9Q91VH2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Snx9Q91VH2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Snx9Q91VH2 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Snx9Q91VH2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Snx9Q91VH2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Snx9Q91VH2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Snx9Q91VH2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Snx9Q91VH2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Snx9Q91VH2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Snx9Q91VH2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Snx9Q91VH2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Snx9Q91VH2 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Snx9Q91VH2 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Snx9Q91VH2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Snx9Q91VH2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Snx9Q91VH2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Snx9Q91VH2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Snx9Q91VH2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Snx9Q91VH2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Snx9Q91VH2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Snx9Q91VH2 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Snx9Q91VH2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Snx9Q91VH2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Snx9Q91VH2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Snx9Q91VH2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Snx9Q91VH2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Snx9Q91VH2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Snx9Q91VH2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Snx9Q91VH2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Snx9Q91VH2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Snx9Q91VH2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Snx9Q91VH2 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Snx9Q91VH2 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Snx9Q91VH2 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Snx9Q91VH2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Snx9Q91VH2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Snx9Q91VH2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Snx9Q91VH2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Snx9Q91VH2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Snx9Q91VH2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Snx9Q91VH2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Snx9Q91VH2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Snx9Q91VH2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Snx9Q91VH2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Snx9Q91VH2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Snx9Q91VH2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Snx9Q91VH2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Snx9Q91VH2 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Snx9Q91VH2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Snx9Q91VH2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Snx9Q91VH2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Snx9Q91VH2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms