Protein–RNA interactions for Protein: Q91V10

Vsx1, Visual system homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsx1Q91V10 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vsx1Q91V10 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Vsx1Q91V10 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vsx1Q91V10 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Vsx1Q91V10 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vsx1Q91V10 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vsx1Q91V10 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vsx1Q91V10 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vsx1Q91V10 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vsx1Q91V10 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vsx1Q91V10 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vsx1Q91V10 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vsx1Q91V10 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vsx1Q91V10 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vsx1Q91V10 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vsx1Q91V10 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Vsx1Q91V10 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vsx1Q91V10 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vsx1Q91V10 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vsx1Q91V10 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Vsx1Q91V10 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vsx1Q91V10 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vsx1Q91V10 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vsx1Q91V10 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vsx1Q91V10 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vsx1Q91V10 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vsx1Q91V10 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Vsx1Q91V10 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vsx1Q91V10 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vsx1Q91V10 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vsx1Q91V10 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vsx1Q91V10 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vsx1Q91V10 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vsx1Q91V10 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vsx1Q91V10 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vsx1Q91V10 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vsx1Q91V10 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vsx1Q91V10 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vsx1Q91V10 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vsx1Q91V10 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vsx1Q91V10 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vsx1Q91V10 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Vsx1Q91V10 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vsx1Q91V10 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vsx1Q91V10 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vsx1Q91V10 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vsx1Q91V10 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Vsx1Q91V10 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vsx1Q91V10 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Vsx1Q91V10 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vsx1Q91V10 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vsx1Q91V10 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vsx1Q91V10 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Vsx1Q91V10 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vsx1Q91V10 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vsx1Q91V10 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vsx1Q91V10 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vsx1Q91V10 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vsx1Q91V10 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vsx1Q91V10 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vsx1Q91V10 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vsx1Q91V10 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vsx1Q91V10 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vsx1Q91V10 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Vsx1Q91V10 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vsx1Q91V10 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vsx1Q91V10 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vsx1Q91V10 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vsx1Q91V10 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vsx1Q91V10 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vsx1Q91V10 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vsx1Q91V10 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vsx1Q91V10 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vsx1Q91V10 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vsx1Q91V10 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Vsx1Q91V10 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vsx1Q91V10 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Vsx1Q91V10 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Vsx1Q91V10 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Vsx1Q91V10 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Vsx1Q91V10 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Vsx1Q91V10 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vsx1Q91V10 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vsx1Q91V10 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vsx1Q91V10 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vsx1Q91V10 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vsx1Q91V10 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vsx1Q91V10 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vsx1Q91V10 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vsx1Q91V10 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vsx1Q91V10 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vsx1Q91V10 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vsx1Q91V10 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vsx1Q91V10 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vsx1Q91V10 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vsx1Q91V10 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vsx1Q91V10 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vsx1Q91V10 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vsx1Q91V10 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vsx1Q91V10 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms