Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE1

Dnajc28, DnaJ homolog subfamily C member 28, mousemouse

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc28Q8VCE1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Dnajc28Q8VCE1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Dnajc28Q8VCE1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Dnajc28Q8VCE1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Dnajc28Q8VCE1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Dnajc28Q8VCE1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Dnajc28Q8VCE1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Dnajc28Q8VCE1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Dnajc28Q8VCE1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Dnajc28Q8VCE1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Dnajc28Q8VCE1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Dnajc28Q8VCE1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Dnajc28Q8VCE1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Dnajc28Q8VCE1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Dnajc28Q8VCE1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Dnajc28Q8VCE1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Dnajc28Q8VCE1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Dnajc28Q8VCE1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Dnajc28Q8VCE1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Dnajc28Q8VCE1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Dnajc28Q8VCE1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Dnajc28Q8VCE1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Dnajc28Q8VCE1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Dnajc28Q8VCE1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Dnajc28Q8VCE1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Dnajc28Q8VCE1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Dnajc28Q8VCE1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Dnajc28Q8VCE1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Dnajc28Q8VCE1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Dnajc28Q8VCE1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Dnajc28Q8VCE1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Dnajc28Q8VCE1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Dnajc28Q8VCE1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Dnajc28Q8VCE1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Dnajc28Q8VCE1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Dnajc28Q8VCE1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Dnajc28Q8VCE1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Dnajc28Q8VCE1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Dnajc28Q8VCE1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Dnajc28Q8VCE1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Dnajc28Q8VCE1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Dnajc28Q8VCE1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Dnajc28Q8VCE1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Dnajc28Q8VCE1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Dnajc28Q8VCE1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Dnajc28Q8VCE1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Dnajc28Q8VCE1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Dnajc28Q8VCE1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Dnajc28Q8VCE1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Dnajc28Q8VCE1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Dnajc28Q8VCE1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Dnajc28Q8VCE1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Dnajc28Q8VCE1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Dnajc28Q8VCE1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Dnajc28Q8VCE1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Dnajc28Q8VCE1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Dnajc28Q8VCE1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Dnajc28Q8VCE1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Dnajc28Q8VCE1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Dnajc28Q8VCE1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Dnajc28Q8VCE1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Dnajc28Q8VCE1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Dnajc28Q8VCE1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Dnajc28Q8VCE1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Dnajc28Q8VCE1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Dnajc28Q8VCE1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Dnajc28Q8VCE1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Dnajc28Q8VCE1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Dnajc28Q8VCE1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Dnajc28Q8VCE1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Dnajc28Q8VCE1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Dnajc28Q8VCE1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Dnajc28Q8VCE1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Dnajc28Q8VCE1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Dnajc28Q8VCE1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Dnajc28Q8VCE1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Dnajc28Q8VCE1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Dnajc28Q8VCE1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Dnajc28Q8VCE1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Dnajc28Q8VCE1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Dnajc28Q8VCE1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Dnajc28Q8VCE1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Dnajc28Q8VCE1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Dnajc28Q8VCE1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Dnajc28Q8VCE1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Dnajc28Q8VCE1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Dnajc28Q8VCE1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Dnajc28Q8VCE1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Dnajc28Q8VCE1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Dnajc28Q8VCE1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Dnajc28Q8VCE1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Dnajc28Q8VCE1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Dnajc28Q8VCE1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Dnajc28Q8VCE1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Dnajc28Q8VCE1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Dnajc28Q8VCE1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Dnajc28Q8VCE1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Dnajc28Q8VCE1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Dnajc28Q8VCE1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Dnajc28Q8VCE1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
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