Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT2

Sds, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SdsQ8VBT2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SdsQ8VBT2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SdsQ8VBT2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SdsQ8VBT2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SdsQ8VBT2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SdsQ8VBT2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SdsQ8VBT2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SdsQ8VBT2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SdsQ8VBT2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SdsQ8VBT2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SdsQ8VBT2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SdsQ8VBT2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SdsQ8VBT2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SdsQ8VBT2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SdsQ8VBT2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SdsQ8VBT2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SdsQ8VBT2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SdsQ8VBT2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SdsQ8VBT2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SdsQ8VBT2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SdsQ8VBT2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SdsQ8VBT2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SdsQ8VBT2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SdsQ8VBT2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SdsQ8VBT2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SdsQ8VBT2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SdsQ8VBT2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SdsQ8VBT2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SdsQ8VBT2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SdsQ8VBT2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SdsQ8VBT2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SdsQ8VBT2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SdsQ8VBT2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SdsQ8VBT2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SdsQ8VBT2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
SdsQ8VBT2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SdsQ8VBT2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SdsQ8VBT2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SdsQ8VBT2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SdsQ8VBT2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SdsQ8VBT2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SdsQ8VBT2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SdsQ8VBT2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SdsQ8VBT2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SdsQ8VBT2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SdsQ8VBT2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SdsQ8VBT2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SdsQ8VBT2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SdsQ8VBT2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SdsQ8VBT2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SdsQ8VBT2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SdsQ8VBT2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SdsQ8VBT2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SdsQ8VBT2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SdsQ8VBT2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SdsQ8VBT2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SdsQ8VBT2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SdsQ8VBT2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SdsQ8VBT2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SdsQ8VBT2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SdsQ8VBT2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SdsQ8VBT2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SdsQ8VBT2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SdsQ8VBT2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SdsQ8VBT2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SdsQ8VBT2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SdsQ8VBT2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SdsQ8VBT2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SdsQ8VBT2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SdsQ8VBT2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SdsQ8VBT2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SdsQ8VBT2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SdsQ8VBT2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SdsQ8VBT2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SdsQ8VBT2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SdsQ8VBT2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SdsQ8VBT2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SdsQ8VBT2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SdsQ8VBT2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SdsQ8VBT2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SdsQ8VBT2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SdsQ8VBT2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SdsQ8VBT2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SdsQ8VBT2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SdsQ8VBT2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SdsQ8VBT2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SdsQ8VBT2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SdsQ8VBT2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SdsQ8VBT2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SdsQ8VBT2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SdsQ8VBT2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SdsQ8VBT2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SdsQ8VBT2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SdsQ8VBT2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SdsQ8VBT2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SdsQ8VBT2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SdsQ8VBT2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SdsQ8VBT2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SdsQ8VBT2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
SdsQ8VBT2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.3 ms