Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT1

Txlnb, Beta-taxilin, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TxlnbQ8VBT1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TxlnbQ8VBT1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TxlnbQ8VBT1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TxlnbQ8VBT1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TxlnbQ8VBT1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TxlnbQ8VBT1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TxlnbQ8VBT1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TxlnbQ8VBT1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TxlnbQ8VBT1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TxlnbQ8VBT1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TxlnbQ8VBT1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TxlnbQ8VBT1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TxlnbQ8VBT1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TxlnbQ8VBT1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TxlnbQ8VBT1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TxlnbQ8VBT1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TxlnbQ8VBT1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TxlnbQ8VBT1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TxlnbQ8VBT1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TxlnbQ8VBT1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TxlnbQ8VBT1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TxlnbQ8VBT1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TxlnbQ8VBT1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TxlnbQ8VBT1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TxlnbQ8VBT1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TxlnbQ8VBT1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TxlnbQ8VBT1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TxlnbQ8VBT1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TxlnbQ8VBT1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TxlnbQ8VBT1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TxlnbQ8VBT1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TxlnbQ8VBT1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TxlnbQ8VBT1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TxlnbQ8VBT1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TxlnbQ8VBT1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TxlnbQ8VBT1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TxlnbQ8VBT1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TxlnbQ8VBT1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TxlnbQ8VBT1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TxlnbQ8VBT1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TxlnbQ8VBT1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TxlnbQ8VBT1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TxlnbQ8VBT1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TxlnbQ8VBT1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TxlnbQ8VBT1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TxlnbQ8VBT1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TxlnbQ8VBT1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TxlnbQ8VBT1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TxlnbQ8VBT1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TxlnbQ8VBT1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TxlnbQ8VBT1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TxlnbQ8VBT1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TxlnbQ8VBT1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TxlnbQ8VBT1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TxlnbQ8VBT1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TxlnbQ8VBT1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TxlnbQ8VBT1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TxlnbQ8VBT1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TxlnbQ8VBT1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TxlnbQ8VBT1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TxlnbQ8VBT1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TxlnbQ8VBT1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TxlnbQ8VBT1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TxlnbQ8VBT1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TxlnbQ8VBT1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TxlnbQ8VBT1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TxlnbQ8VBT1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TxlnbQ8VBT1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TxlnbQ8VBT1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TxlnbQ8VBT1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TxlnbQ8VBT1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TxlnbQ8VBT1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TxlnbQ8VBT1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TxlnbQ8VBT1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TxlnbQ8VBT1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TxlnbQ8VBT1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TxlnbQ8VBT1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TxlnbQ8VBT1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TxlnbQ8VBT1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TxlnbQ8VBT1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TxlnbQ8VBT1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TxlnbQ8VBT1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TxlnbQ8VBT1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TxlnbQ8VBT1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TxlnbQ8VBT1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TxlnbQ8VBT1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TxlnbQ8VBT1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TxlnbQ8VBT1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TxlnbQ8VBT1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TxlnbQ8VBT1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TxlnbQ8VBT1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TxlnbQ8VBT1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TxlnbQ8VBT1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TxlnbQ8VBT1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TxlnbQ8VBT1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TxlnbQ8VBT1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TxlnbQ8VBT1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TxlnbQ8VBT1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.51
TxlnbQ8VBT1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TxlnbQ8VBT1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms