Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4B8

Nlrp3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,033 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp3Q8R4B8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Nlrp3Q8R4B8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Nlrp3Q8R4B8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Nlrp3Q8R4B8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Nlrp3Q8R4B8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Nlrp3Q8R4B8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Nlrp3Q8R4B8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Nlrp3Q8R4B8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Nlrp3Q8R4B8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Nlrp3Q8R4B8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Nlrp3Q8R4B8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Nlrp3Q8R4B8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Nlrp3Q8R4B8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Nlrp3Q8R4B8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Nlrp3Q8R4B8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Nlrp3Q8R4B8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Nlrp3Q8R4B8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Nlrp3Q8R4B8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Nlrp3Q8R4B8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Nlrp3Q8R4B8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Nlrp3Q8R4B8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Nlrp3Q8R4B8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Nlrp3Q8R4B8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Nlrp3Q8R4B8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Nlrp3Q8R4B8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Nlrp3Q8R4B8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Nlrp3Q8R4B8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Nlrp3Q8R4B8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Nlrp3Q8R4B8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Nlrp3Q8R4B8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Nlrp3Q8R4B8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Nlrp3Q8R4B8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Nlrp3Q8R4B8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Nlrp3Q8R4B8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Nlrp3Q8R4B8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Nlrp3Q8R4B8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Nlrp3Q8R4B8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Nlrp3Q8R4B8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Nlrp3Q8R4B8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Nlrp3Q8R4B8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Nlrp3Q8R4B8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Nlrp3Q8R4B8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Nlrp3Q8R4B8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Nlrp3Q8R4B8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Nlrp3Q8R4B8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Nlrp3Q8R4B8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Nlrp3Q8R4B8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Nlrp3Q8R4B8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Nlrp3Q8R4B8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Nlrp3Q8R4B8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Nlrp3Q8R4B8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Nlrp3Q8R4B8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Nlrp3Q8R4B8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Nlrp3Q8R4B8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Nlrp3Q8R4B8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Nlrp3Q8R4B8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Nlrp3Q8R4B8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Nlrp3Q8R4B8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Nlrp3Q8R4B8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Nlrp3Q8R4B8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Nlrp3Q8R4B8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Nlrp3Q8R4B8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Nlrp3Q8R4B8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Nlrp3Q8R4B8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Nlrp3Q8R4B8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Nlrp3Q8R4B8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Nlrp3Q8R4B8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Nlrp3Q8R4B8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Nlrp3Q8R4B8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Nlrp3Q8R4B8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Nlrp3Q8R4B8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Nlrp3Q8R4B8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Nlrp3Q8R4B8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Nlrp3Q8R4B8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Nlrp3Q8R4B8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Nlrp3Q8R4B8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Nlrp3Q8R4B8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Nlrp3Q8R4B8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Nlrp3Q8R4B8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Nlrp3Q8R4B8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Nlrp3Q8R4B8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Nlrp3Q8R4B8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Nlrp3Q8R4B8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Nlrp3Q8R4B8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Nlrp3Q8R4B8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Nlrp3Q8R4B8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Nlrp3Q8R4B8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Nlrp3Q8R4B8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Nlrp3Q8R4B8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Nlrp3Q8R4B8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Nlrp3Q8R4B8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Nlrp3Q8R4B8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Nlrp3Q8R4B8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Nlrp3Q8R4B8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Nlrp3Q8R4B8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Nlrp3Q8R4B8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Nlrp3Q8R4B8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Nlrp3Q8R4B8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Nlrp3Q8R4B8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Nlrp3Q8R4B8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.1 ms