Protein–RNA interactions for Protein: Q8R464

Cadm4, Cell adhesion molecule 4, mousemouse

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cadm4Q8R464 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cadm4Q8R464 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cadm4Q8R464 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cadm4Q8R464 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cadm4Q8R464 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cadm4Q8R464 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cadm4Q8R464 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Cadm4Q8R464 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cadm4Q8R464 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cadm4Q8R464 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cadm4Q8R464 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Cadm4Q8R464 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cadm4Q8R464 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cadm4Q8R464 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cadm4Q8R464 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cadm4Q8R464 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cadm4Q8R464 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cadm4Q8R464 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cadm4Q8R464 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Cadm4Q8R464 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cadm4Q8R464 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cadm4Q8R464 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cadm4Q8R464 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cadm4Q8R464 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cadm4Q8R464 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cadm4Q8R464 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cadm4Q8R464 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cadm4Q8R464 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cadm4Q8R464 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cadm4Q8R464 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cadm4Q8R464 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cadm4Q8R464 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Cadm4Q8R464 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cadm4Q8R464 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Cadm4Q8R464 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cadm4Q8R464 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cadm4Q8R464 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cadm4Q8R464 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cadm4Q8R464 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cadm4Q8R464 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Cadm4Q8R464 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cadm4Q8R464 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Cadm4Q8R464 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cadm4Q8R464 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cadm4Q8R464 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Cadm4Q8R464 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cadm4Q8R464 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cadm4Q8R464 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cadm4Q8R464 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cadm4Q8R464 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cadm4Q8R464 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cadm4Q8R464 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cadm4Q8R464 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cadm4Q8R464 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cadm4Q8R464 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cadm4Q8R464 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cadm4Q8R464 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Cadm4Q8R464 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cadm4Q8R464 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cadm4Q8R464 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cadm4Q8R464 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cadm4Q8R464 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cadm4Q8R464 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cadm4Q8R464 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Cadm4Q8R464 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cadm4Q8R464 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cadm4Q8R464 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cadm4Q8R464 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cadm4Q8R464 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cadm4Q8R464 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cadm4Q8R464 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cadm4Q8R464 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cadm4Q8R464 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Cadm4Q8R464 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cadm4Q8R464 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cadm4Q8R464 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cadm4Q8R464 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cadm4Q8R464 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cadm4Q8R464 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cadm4Q8R464 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cadm4Q8R464 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cadm4Q8R464 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cadm4Q8R464 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cadm4Q8R464 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cadm4Q8R464 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cadm4Q8R464 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cadm4Q8R464 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cadm4Q8R464 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Cadm4Q8R464 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cadm4Q8R464 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Cadm4Q8R464 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cadm4Q8R464 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cadm4Q8R464 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cadm4Q8R464 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Cadm4Q8R464 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cadm4Q8R464 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cadm4Q8R464 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cadm4Q8R464 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cadm4Q8R464 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cadm4Q8R464 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms