Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3C1

Uncharacterized protein C2orf42 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8R3C1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q8R3C1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q8R3C1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q8R3C1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q8R3C1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Q8R3C1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q8R3C1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Q8R3C1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q8R3C1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Q8R3C1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q8R3C1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q8R3C1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Q8R3C1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q8R3C1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q8R3C1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q8R3C1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q8R3C1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q8R3C1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q8R3C1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q8R3C1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q8R3C1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q8R3C1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q8R3C1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q8R3C1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q8R3C1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q8R3C1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q8R3C1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q8R3C1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q8R3C1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q8R3C1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q8R3C1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q8R3C1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q8R3C1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q8R3C1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Q8R3C1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Q8R3C1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Q8R3C1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Q8R3C1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q8R3C1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q8R3C1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q8R3C1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q8R3C1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q8R3C1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q8R3C1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q8R3C1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q8R3C1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q8R3C1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q8R3C1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q8R3C1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q8R3C1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q8R3C1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q8R3C1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q8R3C1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q8R3C1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q8R3C1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q8R3C1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Q8R3C1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q8R3C1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q8R3C1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q8R3C1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q8R3C1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q8R3C1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q8R3C1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q8R3C1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q8R3C1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q8R3C1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q8R3C1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q8R3C1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q8R3C1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q8R3C1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q8R3C1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q8R3C1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q8R3C1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q8R3C1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q8R3C1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q8R3C1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q8R3C1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q8R3C1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q8R3C1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q8R3C1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Q8R3C1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q8R3C1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Q8R3C1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q8R3C1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q8R3C1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q8R3C1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q8R3C1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q8R3C1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q8R3C1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q8R3C1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q8R3C1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q8R3C1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q8R3C1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q8R3C1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q8R3C1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q8R3C1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q8R3C1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q8R3C1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q8R3C1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Q8R3C1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms