Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2G6

Ccdc80, Coiled-coil domain-containing protein 80, mousemouse

Predictions only

Length 949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc80Q8R2G6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc80Q8R2G6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc80Q8R2G6 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc80Q8R2G6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc80Q8R2G6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc80Q8R2G6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc80Q8R2G6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc80Q8R2G6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc80Q8R2G6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc80Q8R2G6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc80Q8R2G6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc80Q8R2G6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc80Q8R2G6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc80Q8R2G6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc80Q8R2G6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc80Q8R2G6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc80Q8R2G6 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc80Q8R2G6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc80Q8R2G6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc80Q8R2G6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc80Q8R2G6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc80Q8R2G6 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc80Q8R2G6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc80Q8R2G6 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc80Q8R2G6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc80Q8R2G6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc80Q8R2G6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc80Q8R2G6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc80Q8R2G6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc80Q8R2G6 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc80Q8R2G6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc80Q8R2G6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc80Q8R2G6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc80Q8R2G6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc80Q8R2G6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc80Q8R2G6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc80Q8R2G6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc80Q8R2G6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc80Q8R2G6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc80Q8R2G6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc80Q8R2G6 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc80Q8R2G6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc80Q8R2G6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc80Q8R2G6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc80Q8R2G6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc80Q8R2G6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc80Q8R2G6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc80Q8R2G6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ccdc80Q8R2G6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc80Q8R2G6 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc80Q8R2G6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc80Q8R2G6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc80Q8R2G6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc80Q8R2G6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc80Q8R2G6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc80Q8R2G6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc80Q8R2G6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc80Q8R2G6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc80Q8R2G6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc80Q8R2G6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc80Q8R2G6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc80Q8R2G6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc80Q8R2G6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc80Q8R2G6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc80Q8R2G6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc80Q8R2G6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc80Q8R2G6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc80Q8R2G6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc80Q8R2G6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc80Q8R2G6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc80Q8R2G6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc80Q8R2G6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc80Q8R2G6 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc80Q8R2G6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc80Q8R2G6 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc80Q8R2G6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc80Q8R2G6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc80Q8R2G6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc80Q8R2G6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc80Q8R2G6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc80Q8R2G6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc80Q8R2G6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc80Q8R2G6 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc80Q8R2G6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc80Q8R2G6 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc80Q8R2G6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc80Q8R2G6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc80Q8R2G6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc80Q8R2G6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc80Q8R2G6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc80Q8R2G6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc80Q8R2G6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc80Q8R2G6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc80Q8R2G6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc80Q8R2G6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc80Q8R2G6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc80Q8R2G6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc80Q8R2G6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc80Q8R2G6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc80Q8R2G6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms