Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0W1

Cipc, CLOCK-interacting pacemaker, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CipcQ8R0W1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CipcQ8R0W1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CipcQ8R0W1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CipcQ8R0W1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CipcQ8R0W1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CipcQ8R0W1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CipcQ8R0W1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CipcQ8R0W1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CipcQ8R0W1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CipcQ8R0W1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CipcQ8R0W1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CipcQ8R0W1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CipcQ8R0W1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CipcQ8R0W1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CipcQ8R0W1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CipcQ8R0W1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CipcQ8R0W1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CipcQ8R0W1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CipcQ8R0W1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CipcQ8R0W1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CipcQ8R0W1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CipcQ8R0W1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CipcQ8R0W1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CipcQ8R0W1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CipcQ8R0W1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CipcQ8R0W1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CipcQ8R0W1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CipcQ8R0W1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CipcQ8R0W1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CipcQ8R0W1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CipcQ8R0W1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CipcQ8R0W1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CipcQ8R0W1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CipcQ8R0W1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CipcQ8R0W1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CipcQ8R0W1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CipcQ8R0W1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CipcQ8R0W1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CipcQ8R0W1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CipcQ8R0W1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CipcQ8R0W1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CipcQ8R0W1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CipcQ8R0W1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CipcQ8R0W1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CipcQ8R0W1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CipcQ8R0W1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CipcQ8R0W1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CipcQ8R0W1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CipcQ8R0W1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CipcQ8R0W1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CipcQ8R0W1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CipcQ8R0W1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CipcQ8R0W1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CipcQ8R0W1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CipcQ8R0W1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CipcQ8R0W1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CipcQ8R0W1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CipcQ8R0W1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CipcQ8R0W1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CipcQ8R0W1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CipcQ8R0W1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CipcQ8R0W1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CipcQ8R0W1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CipcQ8R0W1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CipcQ8R0W1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CipcQ8R0W1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CipcQ8R0W1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CipcQ8R0W1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CipcQ8R0W1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CipcQ8R0W1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CipcQ8R0W1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CipcQ8R0W1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CipcQ8R0W1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CipcQ8R0W1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CipcQ8R0W1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CipcQ8R0W1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CipcQ8R0W1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CipcQ8R0W1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CipcQ8R0W1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CipcQ8R0W1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CipcQ8R0W1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CipcQ8R0W1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CipcQ8R0W1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CipcQ8R0W1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CipcQ8R0W1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CipcQ8R0W1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CipcQ8R0W1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CipcQ8R0W1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CipcQ8R0W1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CipcQ8R0W1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CipcQ8R0W1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CipcQ8R0W1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CipcQ8R0W1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CipcQ8R0W1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CipcQ8R0W1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CipcQ8R0W1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CipcQ8R0W1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CipcQ8R0W1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CipcQ8R0W1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CipcQ8R0W1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
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