Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4J0

Dclre1c, Protein artemis, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclre1cQ8K4J0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dclre1cQ8K4J0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dclre1cQ8K4J0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dclre1cQ8K4J0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Dclre1cQ8K4J0 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Dclre1cQ8K4J0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Dclre1cQ8K4J0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dclre1cQ8K4J0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dclre1cQ8K4J0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dclre1cQ8K4J0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dclre1cQ8K4J0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dclre1cQ8K4J0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dclre1cQ8K4J0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dclre1cQ8K4J0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dclre1cQ8K4J0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Dclre1cQ8K4J0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Dclre1cQ8K4J0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Dclre1cQ8K4J0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dclre1cQ8K4J0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dclre1cQ8K4J0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dclre1cQ8K4J0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dclre1cQ8K4J0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dclre1cQ8K4J0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dclre1cQ8K4J0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dclre1cQ8K4J0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dclre1cQ8K4J0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dclre1cQ8K4J0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dclre1cQ8K4J0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Dclre1cQ8K4J0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Dclre1cQ8K4J0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Dclre1cQ8K4J0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Dclre1cQ8K4J0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Dclre1cQ8K4J0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Dclre1cQ8K4J0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Dclre1cQ8K4J0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dclre1cQ8K4J0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dclre1cQ8K4J0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dclre1cQ8K4J0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Dclre1cQ8K4J0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Dclre1cQ8K4J0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Dclre1cQ8K4J0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Dclre1cQ8K4J0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Dclre1cQ8K4J0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dclre1cQ8K4J0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dclre1cQ8K4J0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dclre1cQ8K4J0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dclre1cQ8K4J0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dclre1cQ8K4J0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Dclre1cQ8K4J0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dclre1cQ8K4J0 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Dclre1cQ8K4J0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Dclre1cQ8K4J0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Dclre1cQ8K4J0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dclre1cQ8K4J0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dclre1cQ8K4J0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dclre1cQ8K4J0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dclre1cQ8K4J0 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dclre1cQ8K4J0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dclre1cQ8K4J0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dclre1cQ8K4J0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Dclre1cQ8K4J0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Dclre1cQ8K4J0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dclre1cQ8K4J0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dclre1cQ8K4J0 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dclre1cQ8K4J0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dclre1cQ8K4J0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dclre1cQ8K4J0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dclre1cQ8K4J0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dclre1cQ8K4J0 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Dclre1cQ8K4J0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Dclre1cQ8K4J0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dclre1cQ8K4J0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dclre1cQ8K4J0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dclre1cQ8K4J0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dclre1cQ8K4J0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dclre1cQ8K4J0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dclre1cQ8K4J0 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dclre1cQ8K4J0 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dclre1cQ8K4J0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dclre1cQ8K4J0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dclre1cQ8K4J0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dclre1cQ8K4J0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dclre1cQ8K4J0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dclre1cQ8K4J0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dclre1cQ8K4J0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dclre1cQ8K4J0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dclre1cQ8K4J0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dclre1cQ8K4J0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dclre1cQ8K4J0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dclre1cQ8K4J0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Dclre1cQ8K4J0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dclre1cQ8K4J0 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dclre1cQ8K4J0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dclre1cQ8K4J0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dclre1cQ8K4J0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dclre1cQ8K4J0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dclre1cQ8K4J0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dclre1cQ8K4J0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dclre1cQ8K4J0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dclre1cQ8K4J0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms