Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3M1

Rdh16f2, Cis-retinol/3alpha hydroxysterol short-chain dehydrogenase-like protein, mousemouse

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f2Q8K3M1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rdh16f2Q8K3M1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rdh16f2Q8K3M1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rdh16f2Q8K3M1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rdh16f2Q8K3M1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rdh16f2Q8K3M1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rdh16f2Q8K3M1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rdh16f2Q8K3M1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rdh16f2Q8K3M1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rdh16f2Q8K3M1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rdh16f2Q8K3M1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rdh16f2Q8K3M1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rdh16f2Q8K3M1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rdh16f2Q8K3M1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Rdh16f2Q8K3M1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Rdh16f2Q8K3M1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rdh16f2Q8K3M1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rdh16f2Q8K3M1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rdh16f2Q8K3M1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rdh16f2Q8K3M1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Rdh16f2Q8K3M1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rdh16f2Q8K3M1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rdh16f2Q8K3M1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rdh16f2Q8K3M1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Rdh16f2Q8K3M1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rdh16f2Q8K3M1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rdh16f2Q8K3M1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rdh16f2Q8K3M1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rdh16f2Q8K3M1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rdh16f2Q8K3M1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rdh16f2Q8K3M1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rdh16f2Q8K3M1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rdh16f2Q8K3M1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rdh16f2Q8K3M1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rdh16f2Q8K3M1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rdh16f2Q8K3M1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rdh16f2Q8K3M1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rdh16f2Q8K3M1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Rdh16f2Q8K3M1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rdh16f2Q8K3M1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rdh16f2Q8K3M1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rdh16f2Q8K3M1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rdh16f2Q8K3M1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rdh16f2Q8K3M1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rdh16f2Q8K3M1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rdh16f2Q8K3M1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rdh16f2Q8K3M1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rdh16f2Q8K3M1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Rdh16f2Q8K3M1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Rdh16f2Q8K3M1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rdh16f2Q8K3M1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rdh16f2Q8K3M1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rdh16f2Q8K3M1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Rdh16f2Q8K3M1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rdh16f2Q8K3M1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rdh16f2Q8K3M1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rdh16f2Q8K3M1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rdh16f2Q8K3M1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rdh16f2Q8K3M1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rdh16f2Q8K3M1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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Rdh16f2Q8K3M1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rdh16f2Q8K3M1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rdh16f2Q8K3M1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rdh16f2Q8K3M1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Rdh16f2Q8K3M1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rdh16f2Q8K3M1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rdh16f2Q8K3M1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rdh16f2Q8K3M1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rdh16f2Q8K3M1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rdh16f2Q8K3M1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rdh16f2Q8K3M1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rdh16f2Q8K3M1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Rdh16f2Q8K3M1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rdh16f2Q8K3M1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rdh16f2Q8K3M1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rdh16f2Q8K3M1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rdh16f2Q8K3M1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rdh16f2Q8K3M1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rdh16f2Q8K3M1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rdh16f2Q8K3M1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rdh16f2Q8K3M1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rdh16f2Q8K3M1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rdh16f2Q8K3M1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rdh16f2Q8K3M1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rdh16f2Q8K3M1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rdh16f2Q8K3M1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rdh16f2Q8K3M1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rdh16f2Q8K3M1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rdh16f2Q8K3M1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rdh16f2Q8K3M1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rdh16f2Q8K3M1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rdh16f2Q8K3M1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rdh16f2Q8K3M1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Rdh16f2Q8K3M1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rdh16f2Q8K3M1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rdh16f2Q8K3M1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rdh16f2Q8K3M1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Rdh16f2Q8K3M1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rdh16f2Q8K3M1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
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