Protein–RNA interactions for Protein: Q8K310

Matr3, Matrin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 846 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Matr3Q8K310 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,75■■□□□ 1,71
Matr3Q8K310 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,74■■□□□ 1,71
Matr3Q8K310 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,73■■□□□ 1,71
Matr3Q8K310 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25,73■■□□□ 1,71
Matr3Q8K310 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25,73■■□□□ 1,71
Matr3Q8K310 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,73■■□□□ 1,71
Matr3Q8K310 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25,73■■□□□ 1,71
Matr3Q8K310 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,72■■□□□ 1,71
Matr3Q8K310 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,72■■□□□ 1,71
Matr3Q8K310 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,72■■□□□ 1,71
Matr3Q8K310 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25,71■■□□□ 1,71
Matr3Q8K310 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25,7■■□□□ 1,7
Matr3Q8K310 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25,69■■□□□ 1,7
Matr3Q8K310 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25,69■■□□□ 1,7
Matr3Q8K310 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25,68■■□□□ 1,7
Matr3Q8K310 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25,68■■□□□ 1,7
Matr3Q8K310 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,68■■□□□ 1,7
Matr3Q8K310 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,68■■□□□ 1,7
Matr3Q8K310 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
Matr3Q8K310 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
Matr3Q8K310 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,66■■□□□ 1,7
Matr3Q8K310 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,66■■□□□ 1,7
Matr3Q8K310 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25,65■■□□□ 1,7
Matr3Q8K310 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,64■■□□□ 1,7
Matr3Q8K310 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,64■■□□□ 1,7
Matr3Q8K310 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,64■■□□□ 1,7
Matr3Q8K310 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25,64■■□□□ 1,7
Matr3Q8K310 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,64■■□□□ 1,69
Matr3Q8K310 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
Matr3Q8K310 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,63■■□□□ 1,69
Matr3Q8K310 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
Matr3Q8K310 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,62■■□□□ 1,69
Matr3Q8K310 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25,62■■□□□ 1,69
Matr3Q8K310 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,62■■□□□ 1,69
Matr3Q8K310 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,62■■□□□ 1,69
Matr3Q8K310 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,62■■□□□ 1,69
Matr3Q8K310 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,61■■□□□ 1,69
Matr3Q8K310 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25,61■■□□□ 1,69
Matr3Q8K310 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,6■■□□□ 1,69
Matr3Q8K310 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
Matr3Q8K310 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
Matr3Q8K310 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
Matr3Q8K310 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
Matr3Q8K310 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
Matr3Q8K310 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
Matr3Q8K310 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25,58■■□□□ 1,69
Matr3Q8K310 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
Matr3Q8K310 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
Matr3Q8K310 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,57■■□□□ 1,68
Matr3Q8K310 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25,57■■□□□ 1,68
Matr3Q8K310 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
Matr3Q8K310 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
Matr3Q8K310 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
Matr3Q8K310 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
Matr3Q8K310 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
Matr3Q8K310 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25,55■■□□□ 1,68
Matr3Q8K310 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25,54■■□□□ 1,68
Matr3Q8K310 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,54■■□□□ 1,68
Matr3Q8K310 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,54■■□□□ 1,68
Matr3Q8K310 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,54■■□□□ 1,68
Matr3Q8K310 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25,53■■□□□ 1,68
Matr3Q8K310 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Matr3Q8K310 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25,52■■□□□ 1,68
Matr3Q8K310 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,52■■□□□ 1,68
Matr3Q8K310 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
Matr3Q8K310 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
Matr3Q8K310 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,5■■□□□ 1,67
Matr3Q8K310 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25,5■■□□□ 1,67
Matr3Q8K310 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,49■■□□□ 1,67
Matr3Q8K310 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Matr3Q8K310 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,48■■□□□ 1,67
Matr3Q8K310 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25,48■■□□□ 1,67
Matr3Q8K310 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25,48■■□□□ 1,67
Matr3Q8K310 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
Matr3Q8K310 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
Matr3Q8K310 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25,47■■□□□ 1,67
Matr3Q8K310 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25,46■■□□□ 1,67
Matr3Q8K310 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,46■■□□□ 1,67
Matr3Q8K310 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Matr3Q8K310 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,67
Matr3Q8K310 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25,45■■□□□ 1,67
Matr3Q8K310 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25,45■■□□□ 1,66
Matr3Q8K310 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
Matr3Q8K310 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
Matr3Q8K310 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25,44■■□□□ 1,66
Matr3Q8K310 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25,44■■□□□ 1,66
Matr3Q8K310 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25,44■■□□□ 1,66
Matr3Q8K310 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
Matr3Q8K310 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
Matr3Q8K310 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25,43■■□□□ 1,66
Matr3Q8K310 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Matr3Q8K310 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,43■■□□□ 1,66
Matr3Q8K310 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
Matr3Q8K310 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
Matr3Q8K310 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
Matr3Q8K310 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25,42■■□□□ 1,66
Matr3Q8K310 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
Matr3Q8K310 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
Matr3Q8K310 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25,41■■□□□ 1,66
Matr3Q8K310 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27,5 ms