Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2W3

Txndc11, Thioredoxin domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Txndc11Q8K2W3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Txndc11Q8K2W3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Txndc11Q8K2W3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Txndc11Q8K2W3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Txndc11Q8K2W3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Txndc11Q8K2W3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Txndc11Q8K2W3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Txndc11Q8K2W3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Txndc11Q8K2W3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Txndc11Q8K2W3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Txndc11Q8K2W3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Txndc11Q8K2W3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Txndc11Q8K2W3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Txndc11Q8K2W3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Txndc11Q8K2W3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Txndc11Q8K2W3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Txndc11Q8K2W3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Txndc11Q8K2W3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Txndc11Q8K2W3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Txndc11Q8K2W3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Txndc11Q8K2W3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Txndc11Q8K2W3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Txndc11Q8K2W3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Txndc11Q8K2W3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Txndc11Q8K2W3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Txndc11Q8K2W3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Txndc11Q8K2W3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Txndc11Q8K2W3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Txndc11Q8K2W3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Txndc11Q8K2W3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Txndc11Q8K2W3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Txndc11Q8K2W3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Txndc11Q8K2W3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Txndc11Q8K2W3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Txndc11Q8K2W3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Txndc11Q8K2W3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Txndc11Q8K2W3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Txndc11Q8K2W3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Txndc11Q8K2W3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Txndc11Q8K2W3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Txndc11Q8K2W3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Txndc11Q8K2W3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Txndc11Q8K2W3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Txndc11Q8K2W3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Txndc11Q8K2W3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Txndc11Q8K2W3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Txndc11Q8K2W3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Txndc11Q8K2W3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Txndc11Q8K2W3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Txndc11Q8K2W3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Txndc11Q8K2W3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Txndc11Q8K2W3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Txndc11Q8K2W3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Txndc11Q8K2W3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Txndc11Q8K2W3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Txndc11Q8K2W3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Txndc11Q8K2W3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Txndc11Q8K2W3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Txndc11Q8K2W3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Txndc11Q8K2W3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Txndc11Q8K2W3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Txndc11Q8K2W3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Txndc11Q8K2W3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Txndc11Q8K2W3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Txndc11Q8K2W3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Txndc11Q8K2W3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Txndc11Q8K2W3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Txndc11Q8K2W3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Txndc11Q8K2W3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Txndc11Q8K2W3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Txndc11Q8K2W3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Txndc11Q8K2W3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Txndc11Q8K2W3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Txndc11Q8K2W3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Txndc11Q8K2W3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Txndc11Q8K2W3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Txndc11Q8K2W3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Txndc11Q8K2W3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Txndc11Q8K2W3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Txndc11Q8K2W3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Txndc11Q8K2W3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Txndc11Q8K2W3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Txndc11Q8K2W3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Txndc11Q8K2W3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Txndc11Q8K2W3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Txndc11Q8K2W3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Txndc11Q8K2W3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Txndc11Q8K2W3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Txndc11Q8K2W3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Txndc11Q8K2W3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Txndc11Q8K2W3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Txndc11Q8K2W3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Txndc11Q8K2W3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Txndc11Q8K2W3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Txndc11Q8K2W3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Txndc11Q8K2W3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Txndc11Q8K2W3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Txndc11Q8K2W3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Txndc11Q8K2W3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Txndc11Q8K2W3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms