Protein–RNA interactions for Protein: Q8K285

Fcho1, F-BAR domain only protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcho1Q8K285 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fcho1Q8K285 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fcho1Q8K285 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fcho1Q8K285 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fcho1Q8K285 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fcho1Q8K285 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fcho1Q8K285 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fcho1Q8K285 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fcho1Q8K285 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fcho1Q8K285 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fcho1Q8K285 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fcho1Q8K285 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Fcho1Q8K285 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Fcho1Q8K285 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Fcho1Q8K285 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fcho1Q8K285 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fcho1Q8K285 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fcho1Q8K285 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fcho1Q8K285 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fcho1Q8K285 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fcho1Q8K285 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Fcho1Q8K285 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Fcho1Q8K285 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Fcho1Q8K285 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fcho1Q8K285 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fcho1Q8K285 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fcho1Q8K285 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fcho1Q8K285 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Fcho1Q8K285 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fcho1Q8K285 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fcho1Q8K285 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fcho1Q8K285 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Fcho1Q8K285 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Fcho1Q8K285 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fcho1Q8K285 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fcho1Q8K285 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fcho1Q8K285 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fcho1Q8K285 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fcho1Q8K285 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fcho1Q8K285 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fcho1Q8K285 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Fcho1Q8K285 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fcho1Q8K285 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fcho1Q8K285 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fcho1Q8K285 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fcho1Q8K285 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fcho1Q8K285 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fcho1Q8K285 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fcho1Q8K285 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Fcho1Q8K285 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fcho1Q8K285 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fcho1Q8K285 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fcho1Q8K285 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fcho1Q8K285 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fcho1Q8K285 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fcho1Q8K285 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fcho1Q8K285 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fcho1Q8K285 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fcho1Q8K285 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fcho1Q8K285 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fcho1Q8K285 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fcho1Q8K285 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fcho1Q8K285 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fcho1Q8K285 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fcho1Q8K285 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fcho1Q8K285 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fcho1Q8K285 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fcho1Q8K285 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fcho1Q8K285 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Fcho1Q8K285 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fcho1Q8K285 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fcho1Q8K285 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fcho1Q8K285 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fcho1Q8K285 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fcho1Q8K285 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fcho1Q8K285 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fcho1Q8K285 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fcho1Q8K285 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fcho1Q8K285 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fcho1Q8K285 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fcho1Q8K285 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fcho1Q8K285 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fcho1Q8K285 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fcho1Q8K285 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fcho1Q8K285 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fcho1Q8K285 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fcho1Q8K285 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Fcho1Q8K285 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fcho1Q8K285 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fcho1Q8K285 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fcho1Q8K285 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fcho1Q8K285 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fcho1Q8K285 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fcho1Q8K285 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fcho1Q8K285 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fcho1Q8K285 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fcho1Q8K285 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fcho1Q8K285 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fcho1Q8K285 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fcho1Q8K285 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.7 ms