Protein–RNA interactions for Protein: Q8K243

Trim68, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM68, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim68Q8K243 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trim68Q8K243 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trim68Q8K243 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Trim68Q8K243 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trim68Q8K243 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Trim68Q8K243 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trim68Q8K243 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trim68Q8K243 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trim68Q8K243 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Trim68Q8K243 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trim68Q8K243 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trim68Q8K243 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trim68Q8K243 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trim68Q8K243 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim68Q8K243 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim68Q8K243 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim68Q8K243 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim68Q8K243 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim68Q8K243 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim68Q8K243 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim68Q8K243 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim68Q8K243 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim68Q8K243 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim68Q8K243 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Trim68Q8K243 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Trim68Q8K243 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trim68Q8K243 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim68Q8K243 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim68Q8K243 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim68Q8K243 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trim68Q8K243 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Trim68Q8K243 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trim68Q8K243 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trim68Q8K243 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Trim68Q8K243 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trim68Q8K243 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trim68Q8K243 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trim68Q8K243 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trim68Q8K243 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trim68Q8K243 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trim68Q8K243 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trim68Q8K243 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Trim68Q8K243 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trim68Q8K243 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trim68Q8K243 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trim68Q8K243 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trim68Q8K243 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trim68Q8K243 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trim68Q8K243 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trim68Q8K243 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trim68Q8K243 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trim68Q8K243 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trim68Q8K243 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trim68Q8K243 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim68Q8K243 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim68Q8K243 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim68Q8K243 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim68Q8K243 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim68Q8K243 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim68Q8K243 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim68Q8K243 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim68Q8K243 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim68Q8K243 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Trim68Q8K243 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trim68Q8K243 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim68Q8K243 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim68Q8K243 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trim68Q8K243 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trim68Q8K243 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trim68Q8K243 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim68Q8K243 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim68Q8K243 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim68Q8K243 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim68Q8K243 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim68Q8K243 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim68Q8K243 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim68Q8K243 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim68Q8K243 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trim68Q8K243 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trim68Q8K243 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trim68Q8K243 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Trim68Q8K243 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trim68Q8K243 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trim68Q8K243 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Trim68Q8K243 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trim68Q8K243 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trim68Q8K243 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trim68Q8K243 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trim68Q8K243 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trim68Q8K243 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trim68Q8K243 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trim68Q8K243 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trim68Q8K243 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trim68Q8K243 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trim68Q8K243 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trim68Q8K243 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trim68Q8K243 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trim68Q8K243 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trim68Q8K243 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trim68Q8K243 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms