Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1S3

Unc5b, Netrin receptor UNC5B, mousemouse

Predictions only

Length 945 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Unc5bQ8K1S3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Unc5bQ8K1S3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Unc5bQ8K1S3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Unc5bQ8K1S3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Unc5bQ8K1S3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Unc5bQ8K1S3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Unc5bQ8K1S3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Unc5bQ8K1S3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Unc5bQ8K1S3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Unc5bQ8K1S3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Unc5bQ8K1S3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Unc5bQ8K1S3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Unc5bQ8K1S3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Unc5bQ8K1S3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Unc5bQ8K1S3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Unc5bQ8K1S3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Unc5bQ8K1S3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Unc5bQ8K1S3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Unc5bQ8K1S3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Unc5bQ8K1S3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Unc5bQ8K1S3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Unc5bQ8K1S3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Unc5bQ8K1S3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Unc5bQ8K1S3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Unc5bQ8K1S3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Unc5bQ8K1S3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Unc5bQ8K1S3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Unc5bQ8K1S3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Unc5bQ8K1S3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Unc5bQ8K1S3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Unc5bQ8K1S3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Unc5bQ8K1S3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Unc5bQ8K1S3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Unc5bQ8K1S3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Unc5bQ8K1S3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Unc5bQ8K1S3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Unc5bQ8K1S3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Unc5bQ8K1S3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Unc5bQ8K1S3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Unc5bQ8K1S3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Unc5bQ8K1S3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Unc5bQ8K1S3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Unc5bQ8K1S3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Unc5bQ8K1S3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Unc5bQ8K1S3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Unc5bQ8K1S3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Unc5bQ8K1S3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Unc5bQ8K1S3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Unc5bQ8K1S3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Unc5bQ8K1S3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Unc5bQ8K1S3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Unc5bQ8K1S3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Unc5bQ8K1S3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Unc5bQ8K1S3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Unc5bQ8K1S3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Unc5bQ8K1S3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Unc5bQ8K1S3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Unc5bQ8K1S3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Unc5bQ8K1S3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Unc5bQ8K1S3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Unc5bQ8K1S3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Unc5bQ8K1S3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Unc5bQ8K1S3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Unc5bQ8K1S3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Unc5bQ8K1S3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Unc5bQ8K1S3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Unc5bQ8K1S3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Unc5bQ8K1S3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Unc5bQ8K1S3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Unc5bQ8K1S3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Unc5bQ8K1S3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Unc5bQ8K1S3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Unc5bQ8K1S3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Unc5bQ8K1S3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Unc5bQ8K1S3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Unc5bQ8K1S3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Unc5bQ8K1S3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Unc5bQ8K1S3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Unc5bQ8K1S3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Unc5bQ8K1S3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Unc5bQ8K1S3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Unc5bQ8K1S3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Unc5bQ8K1S3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Unc5bQ8K1S3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Unc5bQ8K1S3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Unc5bQ8K1S3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Unc5bQ8K1S3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Unc5bQ8K1S3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Unc5bQ8K1S3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Unc5bQ8K1S3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Unc5bQ8K1S3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Unc5bQ8K1S3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Unc5bQ8K1S3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Unc5bQ8K1S3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Unc5bQ8K1S3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Unc5bQ8K1S3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Unc5bQ8K1S3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Unc5bQ8K1S3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Unc5bQ8K1S3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Unc5bQ8K1S3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms