Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIF6

Sidt2, SID1 transmembrane family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 832 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sidt2Q8CIF6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sidt2Q8CIF6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sidt2Q8CIF6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sidt2Q8CIF6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sidt2Q8CIF6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sidt2Q8CIF6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sidt2Q8CIF6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sidt2Q8CIF6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sidt2Q8CIF6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sidt2Q8CIF6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sidt2Q8CIF6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sidt2Q8CIF6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Sidt2Q8CIF6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Sidt2Q8CIF6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sidt2Q8CIF6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sidt2Q8CIF6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sidt2Q8CIF6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sidt2Q8CIF6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sidt2Q8CIF6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sidt2Q8CIF6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sidt2Q8CIF6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sidt2Q8CIF6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sidt2Q8CIF6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sidt2Q8CIF6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sidt2Q8CIF6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Sidt2Q8CIF6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sidt2Q8CIF6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sidt2Q8CIF6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sidt2Q8CIF6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sidt2Q8CIF6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sidt2Q8CIF6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sidt2Q8CIF6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sidt2Q8CIF6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sidt2Q8CIF6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Sidt2Q8CIF6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sidt2Q8CIF6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sidt2Q8CIF6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sidt2Q8CIF6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sidt2Q8CIF6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sidt2Q8CIF6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sidt2Q8CIF6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sidt2Q8CIF6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sidt2Q8CIF6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sidt2Q8CIF6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sidt2Q8CIF6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sidt2Q8CIF6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sidt2Q8CIF6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sidt2Q8CIF6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sidt2Q8CIF6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sidt2Q8CIF6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sidt2Q8CIF6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sidt2Q8CIF6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sidt2Q8CIF6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sidt2Q8CIF6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sidt2Q8CIF6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sidt2Q8CIF6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sidt2Q8CIF6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sidt2Q8CIF6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sidt2Q8CIF6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sidt2Q8CIF6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sidt2Q8CIF6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sidt2Q8CIF6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sidt2Q8CIF6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sidt2Q8CIF6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sidt2Q8CIF6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sidt2Q8CIF6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sidt2Q8CIF6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sidt2Q8CIF6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sidt2Q8CIF6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sidt2Q8CIF6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sidt2Q8CIF6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sidt2Q8CIF6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sidt2Q8CIF6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sidt2Q8CIF6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sidt2Q8CIF6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sidt2Q8CIF6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sidt2Q8CIF6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sidt2Q8CIF6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sidt2Q8CIF6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sidt2Q8CIF6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sidt2Q8CIF6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sidt2Q8CIF6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sidt2Q8CIF6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sidt2Q8CIF6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Sidt2Q8CIF6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sidt2Q8CIF6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sidt2Q8CIF6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sidt2Q8CIF6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sidt2Q8CIF6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sidt2Q8CIF6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Sidt2Q8CIF6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sidt2Q8CIF6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sidt2Q8CIF6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sidt2Q8CIF6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Sidt2Q8CIF6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Sidt2Q8CIF6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sidt2Q8CIF6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sidt2Q8CIF6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sidt2Q8CIF6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sidt2Q8CIF6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms