Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHX7

Rftn2, Raftlin-2, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn2Q8CHX7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rftn2Q8CHX7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Rftn2Q8CHX7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Rftn2Q8CHX7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rftn2Q8CHX7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Rftn2Q8CHX7 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Rftn2Q8CHX7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rftn2Q8CHX7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rftn2Q8CHX7 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rftn2Q8CHX7 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rftn2Q8CHX7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rftn2Q8CHX7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Rftn2Q8CHX7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rftn2Q8CHX7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rftn2Q8CHX7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rftn2Q8CHX7 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rftn2Q8CHX7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rftn2Q8CHX7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rftn2Q8CHX7 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rftn2Q8CHX7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rftn2Q8CHX7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Rftn2Q8CHX7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rftn2Q8CHX7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rftn2Q8CHX7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rftn2Q8CHX7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rftn2Q8CHX7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rftn2Q8CHX7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rftn2Q8CHX7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rftn2Q8CHX7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rftn2Q8CHX7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rftn2Q8CHX7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rftn2Q8CHX7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rftn2Q8CHX7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rftn2Q8CHX7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rftn2Q8CHX7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rftn2Q8CHX7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rftn2Q8CHX7 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Rftn2Q8CHX7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rftn2Q8CHX7 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rftn2Q8CHX7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rftn2Q8CHX7 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Rftn2Q8CHX7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rftn2Q8CHX7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rftn2Q8CHX7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rftn2Q8CHX7 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Rftn2Q8CHX7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rftn2Q8CHX7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rftn2Q8CHX7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rftn2Q8CHX7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rftn2Q8CHX7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rftn2Q8CHX7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rftn2Q8CHX7 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Rftn2Q8CHX7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rftn2Q8CHX7 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Rftn2Q8CHX7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rftn2Q8CHX7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rftn2Q8CHX7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rftn2Q8CHX7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rftn2Q8CHX7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rftn2Q8CHX7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rftn2Q8CHX7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rftn2Q8CHX7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rftn2Q8CHX7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rftn2Q8CHX7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rftn2Q8CHX7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rftn2Q8CHX7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rftn2Q8CHX7 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rftn2Q8CHX7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rftn2Q8CHX7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rftn2Q8CHX7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Rftn2Q8CHX7 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rftn2Q8CHX7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rftn2Q8CHX7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rftn2Q8CHX7 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rftn2Q8CHX7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rftn2Q8CHX7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Rftn2Q8CHX7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rftn2Q8CHX7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rftn2Q8CHX7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rftn2Q8CHX7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rftn2Q8CHX7 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Rftn2Q8CHX7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rftn2Q8CHX7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rftn2Q8CHX7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rftn2Q8CHX7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rftn2Q8CHX7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rftn2Q8CHX7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rftn2Q8CHX7 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rftn2Q8CHX7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rftn2Q8CHX7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rftn2Q8CHX7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rftn2Q8CHX7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rftn2Q8CHX7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rftn2Q8CHX7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Rftn2Q8CHX7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rftn2Q8CHX7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rftn2Q8CHX7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rftn2Q8CHX7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rftn2Q8CHX7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rftn2Q8CHX7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms