Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGR7

Upp2, Uridine phosphorylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp2Q8CGR7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Upp2Q8CGR7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Upp2Q8CGR7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Upp2Q8CGR7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Upp2Q8CGR7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Upp2Q8CGR7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Upp2Q8CGR7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Upp2Q8CGR7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Upp2Q8CGR7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Upp2Q8CGR7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Upp2Q8CGR7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Upp2Q8CGR7 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Upp2Q8CGR7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Upp2Q8CGR7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Upp2Q8CGR7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Upp2Q8CGR7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Upp2Q8CGR7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Upp2Q8CGR7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Upp2Q8CGR7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Upp2Q8CGR7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Upp2Q8CGR7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Upp2Q8CGR7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Upp2Q8CGR7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Upp2Q8CGR7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Upp2Q8CGR7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Upp2Q8CGR7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Upp2Q8CGR7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Upp2Q8CGR7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Upp2Q8CGR7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Upp2Q8CGR7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Upp2Q8CGR7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Upp2Q8CGR7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Upp2Q8CGR7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Upp2Q8CGR7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Upp2Q8CGR7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Upp2Q8CGR7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Upp2Q8CGR7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Upp2Q8CGR7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Upp2Q8CGR7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Upp2Q8CGR7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Upp2Q8CGR7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Upp2Q8CGR7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Upp2Q8CGR7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Upp2Q8CGR7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Upp2Q8CGR7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Upp2Q8CGR7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Upp2Q8CGR7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Upp2Q8CGR7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Upp2Q8CGR7 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Upp2Q8CGR7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Upp2Q8CGR7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Upp2Q8CGR7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Upp2Q8CGR7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Upp2Q8CGR7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Upp2Q8CGR7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Upp2Q8CGR7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Upp2Q8CGR7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Upp2Q8CGR7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Upp2Q8CGR7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Upp2Q8CGR7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Upp2Q8CGR7 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Upp2Q8CGR7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Upp2Q8CGR7 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Upp2Q8CGR7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Upp2Q8CGR7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Upp2Q8CGR7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Upp2Q8CGR7 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Upp2Q8CGR7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Upp2Q8CGR7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Upp2Q8CGR7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Upp2Q8CGR7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Upp2Q8CGR7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Upp2Q8CGR7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Upp2Q8CGR7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Upp2Q8CGR7 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Upp2Q8CGR7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Upp2Q8CGR7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Upp2Q8CGR7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Upp2Q8CGR7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Upp2Q8CGR7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Upp2Q8CGR7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Upp2Q8CGR7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Upp2Q8CGR7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Upp2Q8CGR7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Upp2Q8CGR7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Upp2Q8CGR7 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Upp2Q8CGR7 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Upp2Q8CGR7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Upp2Q8CGR7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Upp2Q8CGR7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Upp2Q8CGR7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Upp2Q8CGR7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Upp2Q8CGR7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Upp2Q8CGR7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Upp2Q8CGR7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Upp2Q8CGR7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Upp2Q8CGR7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Upp2Q8CGR7 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Upp2Q8CGR7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Upp2Q8CGR7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms