Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDL9

Ccdc87, Coiled-coil domain-containing protein 87, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc87Q8CDL9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc87Q8CDL9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc87Q8CDL9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc87Q8CDL9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc87Q8CDL9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc87Q8CDL9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc87Q8CDL9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc87Q8CDL9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc87Q8CDL9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ccdc87Q8CDL9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc87Q8CDL9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc87Q8CDL9 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc87Q8CDL9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc87Q8CDL9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc87Q8CDL9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc87Q8CDL9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc87Q8CDL9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc87Q8CDL9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc87Q8CDL9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc87Q8CDL9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc87Q8CDL9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc87Q8CDL9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc87Q8CDL9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc87Q8CDL9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc87Q8CDL9 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc87Q8CDL9 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc87Q8CDL9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc87Q8CDL9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc87Q8CDL9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc87Q8CDL9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc87Q8CDL9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc87Q8CDL9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc87Q8CDL9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc87Q8CDL9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc87Q8CDL9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc87Q8CDL9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc87Q8CDL9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc87Q8CDL9 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc87Q8CDL9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc87Q8CDL9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc87Q8CDL9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ccdc87Q8CDL9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc87Q8CDL9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc87Q8CDL9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc87Q8CDL9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc87Q8CDL9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc87Q8CDL9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc87Q8CDL9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc87Q8CDL9 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc87Q8CDL9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc87Q8CDL9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc87Q8CDL9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc87Q8CDL9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc87Q8CDL9 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc87Q8CDL9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc87Q8CDL9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc87Q8CDL9 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc87Q8CDL9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc87Q8CDL9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc87Q8CDL9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc87Q8CDL9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc87Q8CDL9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccdc87Q8CDL9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccdc87Q8CDL9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc87Q8CDL9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc87Q8CDL9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc87Q8CDL9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc87Q8CDL9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc87Q8CDL9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc87Q8CDL9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc87Q8CDL9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc87Q8CDL9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc87Q8CDL9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc87Q8CDL9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc87Q8CDL9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc87Q8CDL9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc87Q8CDL9 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc87Q8CDL9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc87Q8CDL9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc87Q8CDL9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc87Q8CDL9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc87Q8CDL9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc87Q8CDL9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc87Q8CDL9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc87Q8CDL9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc87Q8CDL9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc87Q8CDL9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc87Q8CDL9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc87Q8CDL9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc87Q8CDL9 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc87Q8CDL9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc87Q8CDL9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc87Q8CDL9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc87Q8CDL9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc87Q8CDL9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc87Q8CDL9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc87Q8CDL9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc87Q8CDL9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc87Q8CDL9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc87Q8CDL9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms