Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDG3

Vcpip1, Deubiquitinating protein VCIP135, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vcpip1Q8CDG3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Vcpip1Q8CDG3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Vcpip1Q8CDG3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Vcpip1Q8CDG3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Vcpip1Q8CDG3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Vcpip1Q8CDG3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Vcpip1Q8CDG3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Vcpip1Q8CDG3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Vcpip1Q8CDG3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Vcpip1Q8CDG3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Vcpip1Q8CDG3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Vcpip1Q8CDG3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Vcpip1Q8CDG3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Vcpip1Q8CDG3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Vcpip1Q8CDG3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Vcpip1Q8CDG3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Vcpip1Q8CDG3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Vcpip1Q8CDG3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Vcpip1Q8CDG3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Vcpip1Q8CDG3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Vcpip1Q8CDG3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Vcpip1Q8CDG3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Vcpip1Q8CDG3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Vcpip1Q8CDG3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Vcpip1Q8CDG3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Vcpip1Q8CDG3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Vcpip1Q8CDG3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Vcpip1Q8CDG3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Vcpip1Q8CDG3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Vcpip1Q8CDG3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Vcpip1Q8CDG3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Vcpip1Q8CDG3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Vcpip1Q8CDG3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Vcpip1Q8CDG3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Vcpip1Q8CDG3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Vcpip1Q8CDG3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Vcpip1Q8CDG3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Vcpip1Q8CDG3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Vcpip1Q8CDG3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Vcpip1Q8CDG3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Vcpip1Q8CDG3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Vcpip1Q8CDG3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Vcpip1Q8CDG3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Vcpip1Q8CDG3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Vcpip1Q8CDG3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Vcpip1Q8CDG3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Vcpip1Q8CDG3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Vcpip1Q8CDG3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Vcpip1Q8CDG3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Vcpip1Q8CDG3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Vcpip1Q8CDG3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Vcpip1Q8CDG3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Vcpip1Q8CDG3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Vcpip1Q8CDG3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Vcpip1Q8CDG3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Vcpip1Q8CDG3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Vcpip1Q8CDG3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Vcpip1Q8CDG3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Vcpip1Q8CDG3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Vcpip1Q8CDG3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Vcpip1Q8CDG3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Vcpip1Q8CDG3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Vcpip1Q8CDG3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Vcpip1Q8CDG3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Vcpip1Q8CDG3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Vcpip1Q8CDG3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Vcpip1Q8CDG3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Vcpip1Q8CDG3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vcpip1Q8CDG3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vcpip1Q8CDG3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vcpip1Q8CDG3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vcpip1Q8CDG3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vcpip1Q8CDG3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vcpip1Q8CDG3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vcpip1Q8CDG3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Vcpip1Q8CDG3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vcpip1Q8CDG3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vcpip1Q8CDG3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Vcpip1Q8CDG3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Vcpip1Q8CDG3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Vcpip1Q8CDG3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Vcpip1Q8CDG3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Vcpip1Q8CDG3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Vcpip1Q8CDG3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Vcpip1Q8CDG3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Vcpip1Q8CDG3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Vcpip1Q8CDG3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Vcpip1Q8CDG3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Vcpip1Q8CDG3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Vcpip1Q8CDG3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Vcpip1Q8CDG3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Vcpip1Q8CDG3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Vcpip1Q8CDG3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Vcpip1Q8CDG3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Vcpip1Q8CDG3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Vcpip1Q8CDG3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Vcpip1Q8CDG3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Vcpip1Q8CDG3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Vcpip1Q8CDG3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Vcpip1Q8CDG3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms